RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529899.1

TSTA3-211, Transcript of tissue specific transplantation antigen P35B, humanhuman

TSL 2

Gene TSTA3, Length 568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSTA3-211ENST00000529899 RAB11FIP3O75154 756 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 TBC1D8O95759 1140 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 GSTO1P78417 241 aa22.93■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 IFIT2P09913 472 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 TM4SF4P48230 202 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 OTUD5Q96G74 571 aa22.92■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 FAM196BA6NMK8 535 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 ENTPD3O75355 529 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 LDHCP07864 332 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF341Q9BYN7 854 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.91■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 DCAF15Q66K64 600 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 TEX11Q8IYF3 940 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 MAGEB6Q8N7X4 407 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 CSADQ9Y600 493 aa22.9■■□□□ 1.26
TSTA3-211ENST00000529899 CAPN15O75808 1086 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 CYP7A1P22680 504 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MIGA1Q8NAN2 632 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PTPN18Q99952 460 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 LRRCC1Q9C099 1032 aa22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 DOCK1Q14185 1865 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 SPDYE5A6NIY4 337 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 UNCXA6NJT0 531 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 SREBF2Q12772 1141 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 SLFNL1Q499Z3 407 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 TSHZ3Q63HK5 1081 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 IFNL1Q8IU54 200 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MS4A4AQ96JQ5 239 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 DCTPP1Q9H773 170 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF112Q9UJU3 913 aa22.88■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 GOLIM4O00461 696 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 CHGBP05060 677 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 BRI3BPQ8WY22 251 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 BOLA2Q9H3K6 86 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 ATAD5Q96QE3 1844 aa22.87■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PHF20L1A8MW92 1017 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 HOOK2Q96ED9 719 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MYH1P12882 1939 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 MYH7P12883 1935 aa22.86■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PPP4CP60510 307 aa22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 IRF6O14896 467 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 ERO1BQ86YB8 467 aa22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 FLT1P17948 1338 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 PDE6AP16499 860 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 CCL15Q16663 113 aa22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
TSTA3-211ENST00000529899 NAV1Q8NEY1 1877 aa22.83■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PTPRFP10586 1907 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 NPM3O75607 178 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 BAG3O95817 575 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ATP5JP18859 108 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 MAP3K12Q12852 859 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 FAM43AQ8N2R8 423 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PAG1Q9NWQ8 432 aa22.82■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 MAP3K10Q02779 954 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 CRHR2Q13324 411 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PPIL2Q13356 520 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 HAUS7Q99871 368 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 MCOLN1Q9GZU1 580 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PALD1Q9ULE6 856 aa22.81■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 GPR25O00155 361 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 DGKZQ13574 1117 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 EXOC6Q8TAG9 804 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 DNAJC18Q9H819 358 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 ZNF532Q9HCE3 1301 aa22.8■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 PLCG2P16885 1265 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 GTF2A2P52657 109 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 EVX2Q03828 476 aa22.79■■□□□ 1.24
TSTA3-211ENST00000529899 SCYL3Q8IZE3 742 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms