RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527168.5

GNPTG-205, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunit gamma, human

TSL 5

Gene GNPTG, Length 1,317 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GNPTG-205	ENST00000527168	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	OTUD7A	Q8TE49	926 aa	Predicted RBP	28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	AIDA	Q96BJ3	306 aa		28.26	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	IGHD	P01880	384 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	DYNLL1	P63167	89 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP3K9	P80192	1104 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	MKRN3	Q13064	507 aa	Known RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	TMED8	Q6PL24	325 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	MIGA1	Q8NAN2	632 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	ZBTB47	Q9UFB7	747 aa	Predicted RBP	28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	AK9	Q5TCS8	1911 aa		28.25	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	FOXN1	O15353	648 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	PDE6A	P16499	860 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	CSRNP1	Q96S65	589 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		28.24	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	SPRYD7	Q5W111	196 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	WRNIP1	Q96S55	665 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	OTOF	Q9HC10	1997 aa		28.23	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	VGLL4	Q14135	290 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	SMC5	Q8IY18	1101 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	ELP3	Q9H9T3	547 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		28.22	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	WNK4	Q96J92	1243 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	CSAD	Q9Y600	493 aa		28.21	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	TTC41P	Q6P2S7	1318 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		28.2	■■■□□ 2.11
GNPTG-205	ENST00000527168	MX1	P20591	662 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CERS3	Q8IU89	383 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	DDX24	Q9GZR7	859 aa	Known RBP eCLIP	28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		28.19	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	SLURP2	P0DP57	97 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	INPP5B	P32019	993 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	ADD2	P35612	726 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	GJA5	P36382	358 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	FLT1	P17948	1338 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	ERC2	O15083	957 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	MAP3K10	Q02779	954 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	B4GALNT3	Q6L9W6	998 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CNKSR2	Q8WXI2	1034 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	OPTN	Q96CV9	577 aa		28.18	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	LNPK	Q9C0E8	428 aa		28.17	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	GLRX3	O76003	335 aa	Known RBP	28.16	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CHGB	P05060	677 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	TSKS	Q9UJT2	592 aa		28.16	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	CA12	O43570	354 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	28.15	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	KBTBD3	Q8NAB2	608 aa		28.15	■■■□□ 2.1
GNPTG-205	ENST00000527168	USP5	P45974	858 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	TM4SF4	P48230	202 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	UBE3C	Q15386	1083 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	OTUD5	Q96G74	571 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	RNF186	Q9NXI6	227 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	PALD1	Q9ULE6	856 aa		28.14	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	FAM196B	A6NMK8	535 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	TBC1D12	O60347	775 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	LBX1	P52954	281 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	NUCB1	Q02818	461 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	SREBF2	Q12772	1141 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	ERO1B	Q86YB8	467 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	STAP2	Q9UGK3	403 aa		28.13	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	PDE1A	P54750	535 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	NOL9	Q5SY16	702 aa	Known RBP	28.12	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	CHD1L	Q86WJ1	897 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	LCORL	Q8N3X6	602 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	28.12	■■■□□ 2.09	3e-6	■■■■■ 31.2
GNPTG-205	ENST00000527168	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		28.12	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	TRPA1	O75762	1119 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	28.11	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	ARMT1	Q9H993	441 aa		28.11	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	MBD4	O95243	580 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		28.1	■■■□□ 2.09
GNPTG-205	ENST00000527168	MYH7	P12883	1935 aa		28.09	■■■□□ 2.09

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