RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524152.5

MSC-AS1-210, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene MSC-AS1, Length 571 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-210ENST00000524152 CXCL11O14625 94 aa11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 BTDP43251 543 aa11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 PSMC4P43686 418 aa11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SCYL3Q8IZE3 742 aa11.7□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 TRIM47Q96LD4 638 aa11.7□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 ZHX2Q9Y6X8 837 aa11.7□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 A0A0C4DFX4 3053 aa11.7□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SRRDQ9UH36 339 aa11.69□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 MYH13Q9UKX3 1938 aa11.68□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa11.68□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 PICALMQ13492 652 aa11.68□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.68□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAET1EQ8TD07 263 aa11.68□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 NEUROD6Q96NK8 337 aa11.68□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 HMG20BQ9P0W2 317 aa11.68□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 BCRP11274 1271 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 FCGRTP55899 365 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 RHBDL3P58872 404 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 GORABQ5T7V8 394 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SPATA5Q8NB90 893 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZNF384Q8TF68 577 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa11.67□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP11.67□□□□□ -0.54
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MSC-AS1-210ENST00000524152 SLURP2P0DP57 97 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 GRK4P32298 578 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 GSTO1P78417 241 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 PI16Q6UXB8 463 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 GADL1Q6ZQY3 521 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.66□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 AK9Q5TCS8 1911 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 BCAR3O75815 825 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 LDHCP07864 332 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 PRKCZQ05513 592 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 MTFR1Q15390 333 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 CLUAP1Q96AJ1 413 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 RAI14Q9P0K7 980 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 TNNQ9UQP3 1299 aa11.65□□□□□ -0.54
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa11.65□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 MCAMP43121 646 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 NKX2-3Q8TAU0 364 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 SHISA4Q96DD7 197 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 MYH2Q9UKX2 1941 aa11.64□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 FAM196BA6NMK8 535 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 GJB1P08034 283 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 CCL5P13501 91 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 GJA8P48165 433 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 UBXN2AP68543 259 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 TEX11Q8IYF3 940 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 TMEM57Q8N5G2 664 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 RNF208Q9H0X6 261 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 LRP2BPQ9P2M1 347 aa11.63□□□□□ -0.55
MSC-AS1-210ENST00000524152 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa11.63□□□□□ -0.55
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