RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517351.5

TCEA1-202, Transcript of transcription elongation factor A1, humanhuman

TSL 4

Gene TCEA1, Length 539 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA1-202ENST00000517351 ANTXR1Q9H6X2 564 aa31.23■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 DCTPP1Q9H773 170 aa31.23■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 BAG3O95817 575 aa31.22■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP31.22■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa31.21■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP31.21■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 DOCK2Q92608 1830 aa31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 NPM3O75607 178 aaKnown RBP31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 INHBEP58166 350 aa31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 ADGRA1Q86SQ6 560 aa31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 TEX11Q8IYF3 940 aa31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP31.2■■■□□ 2.59
TCEA1-202ENST00000517351 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 CYP7A1P22680 504 aa31.19■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP31.19■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa31.19■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa31.19■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 PLCG2P16885 1265 aa31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 INPP5BP32019 993 aa31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 PPP4CP60510 307 aa31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 MAP3K12Q12852 859 aa31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF112Q9UJU3 913 aa31.18■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 MAGEB6Q8N7X4 407 aa31.17■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 OTUD5Q96G74 571 aa31.17■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 LAMB1P07942 1786 aa31.17■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 ATRNL1Q5VV63 1379 aa31.17■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 SPDYE5A6NIY4 337 aa31.16■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 ERO1BQ86YB8 467 aa31.16■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa31.16■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 GOLIM4O00461 696 aa31.15■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 ATP5JP18859 108 aa31.15■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 IFNL1Q8IU54 200 aa31.15■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP31.15■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 BOLA2Q9H3K6 86 aa31.15■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 TBC1D8O95759 1140 aa31.14■■■□□ 2.58
TCEA1-202ENST00000517351 ALDH1A1P00352 501 aa31.13■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP31.13■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 IFFO2Q5TF58 517 aa31.13■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP31.13■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 MAP3K10Q02779 954 aa31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 MIGA1Q8NAN2 632 aa31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 MS4A4AQ96JQ5 239 aa31.12■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP31.11■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 SLURP2P0DP57 97 aa31.11■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 GTF2A2P52657 109 aa31.11■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP31.11■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PAG1Q9NWQ8 432 aa31.11■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PHF20L1A8MW92 1017 aa31.1■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa31.1■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 CERS3Q8IU89 383 aa31.1■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa31.1■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 HAUS7Q99871 368 aa31.1■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PPATQ06203 517 aa31.09■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PPIL2Q13356 520 aa31.09■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa31.09■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa31.09■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 FLT1P17948 1338 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 IRF6O14896 467 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 TBC1D12O60347 775 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PDE6AP16499 860 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 CCL15Q16663 113 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 BRI3BPQ8WY22 251 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 PTPN18Q99952 460 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 CFHR5Q9BXR6 569 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 ECHDC1Q9NTX5 307 aa31.08■■■□□ 2.57
TCEA1-202ENST00000517351 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP31.07■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP31.07■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 FOCADQ5VW36 1801 aa31.07■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 FAM196BA6NMK8 535 aa31.06■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 AAMPQ13685 434 aa31.06■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 SCYL3Q8IZE3 742 aa31.06■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 GPATCH3Q96I76 525 aa31.06■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP31.06■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF532Q9HCE3 1301 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 CETPP11597 493 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 SNAPC2Q13487 334 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 R3HDMLQ9H3Y0 253 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 PICK1Q9NRD5 415 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 PI4KBQ9UBF8 816 aa31.05■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 GPR25O00155 361 aa31.04■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP31.04■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 USP5P45974 858 aa31.04■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa31.03■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP31.03■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 PALD1Q9ULE6 856 aa31.03■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa31.02■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP31.02■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP31.02■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
TCEA1-202ENST00000517351 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.3 ms