RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517164.1

RNU6-1028P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1028, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1028P, Length 93 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UBP1Q9NZI7 540 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa7.58□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DCDC2CA8MYV0 355 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMPRSS2O15393 492 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TLR3O15455 904 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLFN14P0C7P3 912 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PREPP48147 710 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZC3H12AQ5D1E8 599 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRFN4Q6PJG9 635 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TXNRD3Q86VQ6 643 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PLPPR2Q96GM1 343 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 AP4E1Q9UPM8 1137 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CSADQ9Y600 493 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ID3Q02535 119 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C12orf40Q86WS4 652 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TINF2Q9BSI4 451 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CAPN10Q9HC96 672 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CRIM1Q9NZV1 1036 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BPNT1O95861 308 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GJA8P48165 433 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 APOBRQ0VD83 1088 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MPP2Q14168 576 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DYMQ7RTS9 669 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ELMO3Q96BJ8 720 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 LRRC3Q9BY71 257 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CEP41Q9BYV8 373 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ACTL7BQ9Y614 415 aa7.55□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GFRA2O00451 464 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GDF11O95390 407 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ITGB2P05107 769 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ERVK-24P63145 666 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SEZ6Q53EL9 994 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NAALADL2Q58DX5 795 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HDXQ7Z353 690 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 REC114Q7Z4M0 266 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GPRASP2Q96D09 838 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DISC1Q9NRI5 854 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HIF3AQ9Y2N7 669 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RING1Q06587 406 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPM1JQ5JR12 505 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CYFIP1Q7L576 1253 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NKD1Q969G9 470 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 C8orf37Q96NL8 207 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FAM105AQ9NUU6 356 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ROBO2Q9HCK4 1378 aa7.53□□□□□ -1.2
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GAS2O43903 313 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TTLL4Q14679 1199 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 TMEM151AQ8N4L1 468 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ATXN3LQ9H3M9 355 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GSX1Q9H4S2 264 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GRIN3BO60391 1043 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NEFMP07197 916 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 NTF4P34130 210 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ASPAP45381 313 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RNF214Q8ND24 703 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PICK1Q9NRD5 415 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CORINQ9Y5Q5 1042 aa7.51□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 RAB6AP20340 208 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GATA4P43694 442 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 UVSSAQ2YD98 709 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 SGO2Q562F6 1265 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 ZBTB37Q5TC79 503 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 CDPF1Q6NVV7 123 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MYRFLQ96LU7 910 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 PIDD1Q9HB75 910 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GINM1Q9NU53 330 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 GRK4P32298 578 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 MCM4P33991 863 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 USP11P51784 963 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-1028P-201ENST00000517164 FBLIM1Q8WUP2 373 aa7.49□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms