RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516454.1

RNU6-659P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 659, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-659P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZXDAP98168 799 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 PLP2Q04941 152 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 EFEMP1Q12805 493 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 NKPD1Q17RQ9 610 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 POM121Q96HA1 1249 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 FANCD2OSQ96PS1 177 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATXN3LQ9H3M9 355 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SRRDQ9UH36 339 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 GTF2IRD1Q9UHL9 959 aa3.44□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 A6NHS1 94 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 EREGO14944 169 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 FSHBP01225 129 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 EDN3P14138 238 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 LIG1P18858 919 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TTLL4Q14679 1199 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 XKR5Q6UX68 686 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 CAPN12Q6ZSI9 719 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM151BQ8IW70 566 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLC16A11Q8NCK7 471 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 MKNK1Q9BUB5 465 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 MCOLN1Q9GZU1 580 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATP13A1Q9HD20 1204 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 STIM2Q9P246 746 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 PCOLCE2Q9UKZ9 415 aa3.43□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 RFXAPO00287 272 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 PRMT3O60678 531 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 CLCN7P51798 805 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ERVFC1P60507 584 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ID3Q02535 119 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 C8orf34Q49A92 452 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TMEM132EQ6IEE7 984 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM214BQ7L5A3 538 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TTC6Q86TZ1 520 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ATCAYQ86WG3 371 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 NPAS4Q8IUM7 802 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 FAM200AQ8TCP9 573 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 MYLIPQ8WY64 445 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 CCDC120Q96HB5 630 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 MENTQ9BUN1 341 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ADAM7Q9H2U9 754 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 WDR26Q9H7D7 661 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 DISC1Q9NRI5 854 aa3.42□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 A0A096LPE4 126 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 A0A1W2PPZ6 126 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 GNAT3A8MTJ3 354 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 GRIN3BO60391 1043 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLFN14P0C7P3 912 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SSPNQ14714 243 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZNF605Q86T29 641 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ABTB2Q8N961 1025 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 TTC16Q8NEE8 873 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ALPK1Q96QP1 1244 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 BDH2Q9BUT1 245 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SGPP1Q9BX95 441 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 GGNBP2Q9H3C7 697 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 VRTNQ9H8Y1 702 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SLAMF8Q9P0V8 285 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa3.41□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 ADAMTS20P59510 1910 aa3.4□□□□□ -1.86
RNU6-659P-201ENST00000516454 MYOCOSA0A1B0GUC4 107 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 HMGA2P52926 109 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 SPRED3Q2MJR0 410 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 HHIPL2Q6UWX4 724 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 SYT8Q8NBV8 401 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PANK1Q8TE04 598 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 HSPA12BQ96MM6 686 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 SORCS2Q96PQ0 1159 aa3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 RAD21O60216 631 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PHACTR2O75167 634 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 SEMA7AO75326 666 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PCSK2P16519 638 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 TNFRSF1AP19438 455 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PI3P19957 117 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 HK2P52789 917 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 VMACQ2NL98 169 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 CDKAL1Q5VV42 579 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 EDEM1Q92611 657 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 TEPSINQ96N21 525 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 PALD1Q9ULE6 856 aa3.39□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 H3BS24 57 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 NEFMP07197 916 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 TRHRP34981 398 aaPredicted RBP3.38□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 GRIA4P48058 902 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 RALGPS1Q5JS13 557 aa3.38□□□□□ -1.87
RNU6-659P-201ENST00000516454 ISL2Q96A47 359 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.4 ms