RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514552.5

PDE4D-222, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 494 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-222ENST00000514552 NRXN1Q9ULB1 1477 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 PIK3R2O00459 728 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 NPAS4Q8IUM7 802 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 PBX4Q9BYU1 374 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 MKL2Q9ULH7 1088 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 NPHP3Q7Z494 1330 aa10□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa9.99□□□□□ -0.81
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PDE4D-222ENST00000514552 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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PDE4D-222ENST00000514552 ATP11AP98196 1134 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 LINC00114Q6XXX2 140 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 PODNQ7Z5L7 613 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 RASSF4Q9H2L5 321 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 DZANK1Q9NVP4 752 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 FMN2Q9NZ56 1722 aa9.99□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf86Q6ZUL3 223 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 C8orf37Q96NL8 207 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 OSMRQ99650 979 aa9.98□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 ATP2B2Q01814 1243 aa9.97□□□□□ -0.81
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PDE4D-222ENST00000514552 ALG1LQ6GMV1 187 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 FBF1Q8TES7 1133 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 ORAI2Q96SN7 254 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 LATS2Q9NRM7 1088 aa9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
PDE4D-222ENST00000514552 A0A1W2PP55 124 aa9.96□□□□□ -0.82
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PDE4D-222ENST00000514552 GNB5O14775 395 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 NID1P14543 1247 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ACPPP15309 386 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 FGD1P98174 961 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 KIAA0319Q5VV43 1072 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 CEP135Q66GS9 1140 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 MPHOSPH9Q99550 1183 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ATRNO75882 1429 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 DLC1Q96QB1 1528 aa9.96□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 NPHS2Q9NP85 383 aa9.95□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-222ENST00000514552 ADGRB2O60241 1585 aa9.95□□□□□ -0.82
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PDE4D-222ENST00000514552 BHLHE41Q9C0J9 482 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 BCL9LQ86UU0 1499 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 PTPRAP18433 802 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 MSL1Q68DK7 614 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ADAM19Q9H013 955 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 NLRP2Q9NX02 1062 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 USP21Q9UK80 565 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 USP32Q8NFA0 1604 aa9.93□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ANKARQ7Z5J8 1434 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TRPA1O75762 1119 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 IRS1P35568 1242 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 WFDC8Q8IUA0 241 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TRIM11Q96F44 468 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 MUC3BQ9H195 1237 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 EHD4Q9H223 541 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SUV39H2Q9H5I1 410 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 C14orf93Q9H972 538 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 LIN7BQ9HAP6 207 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 WWC3Q9ULE0 1092 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 ADGRB1O14514 1584 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SLIT2O94813 1529 aa9.92□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 TNS3Q68CZ2 1445 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 SPDYE3A6NKU9 549 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 BAG6P46379 1132 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 RGL3Q3MIN7 710 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 CCNJLQ8IV13 435 aa9.91□□□□□ -0.82
PDE4D-222ENST00000514552 IL22RA1Q8N6P7 574 aa9.91□□□□□ -0.82
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