RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513542.1

SMAD1-AS1-201, SMAD1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SMAD1-AS1, Length 481 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LAMB1P07942 1786 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATAD5Q96QE3 1844 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ENTPD3O75355 529 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRKG1Q13976 671 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TTC22Q5TAA0 569 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARMT1Q9H993 441 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MYH8P13535 1937 aa16.15■□□□□ 0.18
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NF2P35240 595 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 APPBP2Q92624 585 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OSBP2Q969R2 916 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RILPL2Q969X0 211 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TLL2Q9Y6L7 1015 aa16.14■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 M0R2C6 588 aa16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 C2orf69Q8N8R5 385 aa16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DOCK1Q14185 1865 aa16.13■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PRKAB2O43741 272 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLURP2P0DP57 97 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SAPCD2Q86UD0 394 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CERS3Q8IU89 383 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SDR42E1Q8WUS8 393 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 AIDAQ96BJ3 306 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CSRNP1Q96S65 589 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 THSD7BQ9C0I4 1608 aa16.12■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 UBE2Q2LH0YL09 131 aa16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP5P45974 858 aa16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HUNKP57058 714 aa16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 A0A0D9SFI3 127 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RASSF10A6NK89 507 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GPAA1O43292 621 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SDSP20132 328 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FKBP1BP68106 108 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MIGA2Q7L4E1 593 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM227BQ96M60 508 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PALD1Q9ULE6 856 aa16.1■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FAM196BA6NMK8 535 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 USP2O75604 605 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MAP3K11Q16584 847 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ARMC9Q7Z3E5 817 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PHIPQ8WWQ0 1821 aa16.09■□□□□ 0.17
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EVX2Q03828 476 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DCAF15Q66K64 600 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LAMA4Q16363 1823 aa16.08■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PCNTO95613 3336 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 IREB2P48200 963 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DEFB115Q30KQ5 88 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 LDLRAD1Q5T700 205 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYP4F22Q6NT55 531 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 KLRG1Q96E93 195 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HOOK2Q96ED9 719 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF341Q9BYN7 854 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PTPRFP10586 1907 aa16.07■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GSG1L2A8MUP6 293 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 FOXP2O15409 715 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYP2D6P10635 497 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 GRM1Q13255 1194 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 RGMBQ6NW40 437 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 TICAM2Q86XR7 235 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HHIPL1Q96JK4 782 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 WRNIP1Q96S55 665 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DNAJC18Q9H819 358 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 HELLSQ9NRZ9 838 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP16.06■□□□□ 0.16
SMAD1-AS1-201ENST00000513542 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms