RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508100.1

ITGA3-211, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 549 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-211ENST00000508100 A0A1B0GUL7 405 aa20.25■□□□□ 0.83
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ITGA3-211ENST00000508100 MAP3K10Q02779 954 aa20.22■□□□□ 0.83
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ITGA3-211ENST00000508100 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
ITGA3-211ENST00000508100 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa20.22■□□□□ 0.83
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ITGA3-211ENST00000508100 MTX1Q13505 466 aa20.21■□□□□ 0.83
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ITGA3-211ENST00000508100 CCL5P13501 91 aa20.2■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 PRKCZQ05513 592 aa20.2■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa20.2■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 GJB1P08034 283 aa20.19■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 HMG20BQ9P0W2 317 aa20.19■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 RAI14Q9P0K7 980 aa20.18■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D12O60347 775 aa20.17■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 BRCA2P51587 3418 aa20.17■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 ADCY3O60266 1144 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 LRP2BPQ9P2M1 347 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 PNMA3Q9UL41 463 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 GABRQQ9UN88 632 aa20.16■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa20.16■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa20.15■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 PI16Q6UXB8 463 aa20.15■□□□□ 0.82
ITGA3-211ENST00000508100 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa20.15■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 DOCK1Q14185 1865 aa20.15■□□□□ 0.82
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ITGA3-211ENST00000508100 FAM196BA6NMK8 535 aa20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TRIM27P14373 513 aa20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 ZNF384Q8TF68 577 aa20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
ITGA3-211ENST00000508100 SPP2Q13103 211 aa20.13■□□□□ 0.81
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ITGA3-211ENST00000508100 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.13■□□□□ 0.81
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