RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506437.1

ITGA3-208, Transcript of integrin subunit alpha 3, human

TSL 2

Gene ITGA3, Length 3,055 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ITGA3-208	ENST00000506437	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	COA1	Q9GZY4	146 aa		13.45	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC66	A2RUB6	948 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	LRRC37A	A6NMS7	1700 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	LTBP1	Q14766	1721 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PSMD14	O00487	310 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	KLHL40	Q2TBA0	621 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TTC12	Q9H892	705 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC4A4	Q9Y6R1	1079 aa		13.44	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	GTF2F1	P35269	517 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MCTP1	Q6DN14	999 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SOCS7	O14512	581 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	FGA	P02671	866 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PICALM	Q13492	652 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	ST7	Q9NRC1	585 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	NOLC1	Q14978	699 aa	Known RBP eCLIP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	GPR162	Q16538	588 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SH3RF3	Q8TEJ3	882 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SNED1	Q8TER0	1413 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RAD50	Q92878	1312 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RIOK3	O14730	519 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CLGN	O14967	610 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	EGFR	P00533	1210 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	EPB41L4A	Q9HCS5	686 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MYH7	P12883	1935 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	HIP1	O00291	1037 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PPFIA3	O75145	1194 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CYP21A2	P08686	494 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CYP2D6	P10635	497 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MCM5	P33992	734 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CXCL9	Q07325	125 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TERF2	Q15554	542 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CREB3L3	Q68CJ9	461 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		13.42	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	NIM1K	Q8IY84	436 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RTFDC1	Q9BY42	306 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RSPH14	Q9UHP6	348 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SYCE3	A1L190	88 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	SLC27A2	O14975	620 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PRDM1	O75626	825 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TCP10	Q12799	353 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	UBE3C	Q15386	1083 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	JDP2	Q8WYK2	163 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MAP4K1	Q92918	833 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TOMM22	Q9NS69	142 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CENPF	P49454	3210 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	BAZ2A	Q9UIF9	1905 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	BTD	P43251	543 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	NEK4	P51957	841 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	GYS2	P54840	703 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	ZNF445	P59923	1031 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	DACT2	Q5SW24	774 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	PODN	Q7Z5L7	613 aa		13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	JAKMIP1	Q96N16	626 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	BAG4	O95429	457 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CAST	P20810	708 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	TDO2	P48775	406 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RRP12	Q5JTH9	1297 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	C15orf52	Q6ZUT6	534 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	STOX1	Q6ZVD7	989 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	RIOK1	Q9BRS2	568 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	CLRN2	A0PK11	232 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	GPHN	Q9NQX3	736 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		13.4	□□□□□ -0.26
ITGA3-208	ENST00000506437	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
ITGA3-208	ENST00000506437	USP17L8	P0C7I0	530 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ITGA3-208	ENST00000506437	HSPA4	P34932	840 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ITGA3-208	ENST00000506437	NECTIN1	Q15223	517 aa		13.39	□□□□□ -0.27
ITGA3-208	ENST00000506437	PSMD1	Q99460	953 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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