RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498284.1

PTPRK-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, human

TSL 5

Gene PTPRK, Length 524 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRK-215	ENST00000498284	GART	P22102	1010 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SNAP47	Q5SQN1	464 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	BNC2	Q6ZN30	1099 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	GOLM1	Q8NBJ4	401 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	CRIM1	Q9NZV1	1036 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ADAMTS1	Q9UHI8	967 aa		7.3	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	F13A1	P00488	732 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	RACK1	P63244	317 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	INPP5A	Q14642	412 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	DIEXF	Q68CQ4	756 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXL19	Q6PCT2	694 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ARMC10	Q8N2F6	343 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	TP53INP1	Q96A56	240 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FANCD2OS	Q96PS1	177 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	GSX1	Q9H4S2	264 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNQ5	Q9NR82	932 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	DISC1	Q9NRI5	854 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	TPSG1	Q9NRR2	321 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ACTL7B	Q9Y614	415 aa		7.29	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM221A	A4D161	298 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ASPA	P45381	313 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	CDK8	P49336	464 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	USP11	P51784	963 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ERVK-24	P63145	666 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	XP32	Q5T750	250 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	LRFN4	Q6PJG9	635 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	HDX	Q7Z353	690 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	C12orf40	Q86WS4	652 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ZNF654	Q8IZM8	581 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	PLPPR2	Q96GM1	343 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SPON2	Q9BUD6	331 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM105A	Q9NUU6	356 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SUPT16H	Q9Y5B9	1047 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	CSAD	Q9Y600	493 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		7.28	□□□□□ -1.24
PTPRK-215	ENST00000498284	GREM1	O60565	184 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CILP	O75339	1184 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	BMP3	P12645	472 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	ERCC5	P28715	1186 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RPL6	Q02878	288 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RAD51AP2	Q09MP3	1159 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	DOC2B	Q14184	412 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	WIPI1	Q5MNZ9	446 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM196A	Q6ZSG2	479 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	KIAA0825	Q8IV33	1275 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	TGIF2	Q9GZN2	237 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	EPB41L3	Q9Y2J2	1087 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	HIF3A	Q9Y2N7	669 aa		7.27	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	GFRA2	O00451	464 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	BPNT1	O95861	308 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RING1	Q06587	406 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	SGO2	Q562F6	1265 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	PPM1J	Q5JR12	505 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CDPF1	Q6NVV7	123 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CYFIP1	Q7L576	1253 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	FBXO27	Q8NI29	283 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	PIDD1	Q9HB75	910 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	PICK1	Q9NRD5	415 aa		7.26	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	ROBO2	Q9HCK4	1378 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	KIR2DP1	A0A0G2JNF4	349 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RAB6A	P20340	208 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	MAP4	P27816	1152 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RXRB	P28702	533 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	TTLL4	Q14679	1199 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RNF214	Q8ND24	703 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	FBLIM1	Q8WUP2	373 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		7.25	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	PRAMEF27	A3QJZ7	478 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	FANCG	O15287	622 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	RNGTT	O60942	597 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	MPP2	Q14168	576 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	BEND4	Q6ZU67	534 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	EAF1	Q96JC9	268 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	NT5C1A	Q9BXI3	368 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	KCNF1	Q9H3M0	494 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	ACSS3	Q9H6R3	686 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CCSER2	Q9H7U1	834 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	UBP1	Q9NZI7	540 aa		7.24	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	NEFM	P07197	916 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	NFIC	P08651	508 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CRK	P46108	304 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	APOBR	Q0VD83	1088 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	ZBTB37	Q5TC79	503 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	CLEC10A	Q8IUN9	316 aa		7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	SMYD4	Q8IYR2	804 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
PTPRK-215	ENST00000498284	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25

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