RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC27A2O14975 620 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CHGBP05060 677 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP7A1P22680 504 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ALX1Q15699 326 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TPRNQ4KMQ1 711 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PODNQ7Z5L7 613 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD7Q92527 254 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 AIDAQ96BJ3 306 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ZBTB9Q96C00 473 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 TBC1D2Q9BYX2 928 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PALD1Q9ULE6 856 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ECM29Q5VYK3 1845 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NAV1Q8NEY1 1877 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SCN9AQ15858 1988 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0G2JLW4 131 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 ST18O60284 1047 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 LDHBP07195 334 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 MCM2P49736 904 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 KIAA2012Q0VF49 1180 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLFNL1Q499Z3 407 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 NBPF11Q86T75 865 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 HSCBQ8IWL3 235 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SLF2Q8IX21 1173 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 GBP4Q96PP9 640 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 SPON1Q9HCB6 807 aa8.47□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 LDHCP07864 332 aa8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 PSMA5P28066 241 aa8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 MECOMQ03112 1051 aa8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 OLFM4Q6UX06 510 aa8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.05
SMARCE1-211ENST00000493660 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 G3V3G9 751 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RIMBP2O15034 1052 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 C21orf2O43822 256 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MBD4O95243 580 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DCAF8Q5TAQ9 597 aa8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXP2O15409 715 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PRDX5P30044 214 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TERF2Q15554 542 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 VPS53Q5VIR6 699 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ICE2Q659A1 982 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GIMAP6Q6P9H5 292 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RASEFQ8IZ41 740 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SH3BP1Q9Y3L3 701 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TTC36A6NLP5 189 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NBPF9Q3BBW0 867 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MFSD14BQ5SR56 506 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 STRIP1Q5VSL9 837 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF384Q8TF68 577 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NACAP1Q9BZK3 213 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.45□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ECE2O60344 883 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP21A2P08686 494 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GUCY2CP25092 1073 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF445P59923 1031 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PPP4CP60510 307 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GTF2IP78347 998 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 SYCP1Q15431 976 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 LCORLQ8N3X6 602 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ARMT1Q9H993 441 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DONSONQ9NYP3 566 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 GAKO14976 1311 aa8.44□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PPIP5K2O43314 1243 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 BAG3O95817 575 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 FGAP02671 866 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 PLCG2P16885 1265 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 NEK4P51957 841 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 DOK7Q18PE1 504 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 TTLL5Q6EMB2 1281 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 RUFY3Q7L099 469 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRA1Q86SQ6 560 aa8.43□□□□□ -1.06
SMARCE1-211ENST00000493660 IFNL3Q8IZI9 196 aa8.43□□□□□ -1.06
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