RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491731.1

USP20-207, Transcript of ubiquitin specific peptidase 20, humanhuman

TSL 2

Gene USP20, Length 821 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20-207ENST00000491731 SAGE1Q9NXZ1 904 aa16.06■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 GOLIM4O00461 696 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 PLCG2P16885 1265 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 TM4SF4P48230 202 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 ADGRA1Q86SQ6 560 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 TNS4Q8IZW8 715 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 MAGEB6Q8N7X4 407 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 BOLA2Q9H3K6 86 aa16.05■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 RFX7Q2KHR2 1363 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 GJA5P36382 358 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 OTUD5Q96G74 571 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 AKAP11Q9UKA4 1901 aa16.04■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 ATP5JP18859 108 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 INPP5BP32019 993 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 INHBEP58166 350 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 PPP4CP60510 307 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 MIGA1Q8NAN2 632 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa16.03■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 TBC1D8O95759 1140 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 ERO1BQ86YB8 467 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 GPATCH3Q96I76 525 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 PAG1Q9NWQ8 432 aa16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
USP20-207ENST00000491731 SPDYE5A6NIY4 337 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 IFNL1Q8IU54 200 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ECHDC1Q9NTX5 307 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ZNF112Q9UJU3 913 aa16.01■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 MAST2Q6P0Q8 1798 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 AK9Q5TCS8 1911 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ALDH1A1P00352 501 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 SLURP2P0DP57 97 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PDE6AP16499 860 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 GTF2A2P52657 109 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CERS3Q8IU89 383 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 HAUS7Q99871 368 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ATRNL1Q5VV63 1379 aa16■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 FLT1P17948 1338 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 OTOFQ9HC10 1997 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 USP5P45974 858 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 AAMPQ13685 434 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CCL15Q16663 113 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 EXOC6Q8TAG9 804 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PICK1Q9NRD5 415 aa15.99■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 FAM196BA6NMK8 535 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PHF20L1A8MW92 1017 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 IRF6O14896 467 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 MAP3K10Q02779 954 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PPATQ06203 517 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PPIL2Q13356 520 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 SNAPC2Q13487 334 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 TSHZ3Q63HK5 1081 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 MS4A4AQ96JQ5 239 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 TRIM34Q9BYJ4 488 aa15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP15.98■□□□□ 0.152e-7■■■■□ 21.8
USP20-207ENST00000491731 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 TBC1D12O60347 775 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CETPP11597 493 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 ANKRD45Q5TZF3 282 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 SCYL3Q8IZE3 742 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 BRI3BPQ8WY22 251 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 GCC1Q96CN9 775 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PTPN18Q99952 460 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PI4KBQ9UBF8 816 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 PALD1Q9ULE6 856 aa15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 HLA-DOAP06340 250 aa15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP20-207ENST00000491731 GPR25O00155 361 aa15.95■□□□□ 0.14
USP20-207ENST00000491731 PTPRAP18433 802 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.5 ms