RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490669.1

JMJD1C-208, Transcript of jumonji domain containing 1C, humanhuman

TSL 2

Gene JMJD1C, Length 518 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1C-208ENST00000490669 TNFRSF25Q93038 417 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 HSH2DQ96JZ2 352 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 UCN2Q96RP3 112 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.08□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 M0R082 166 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 CYP27B1O15528 508 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PRRT3Q5FWE3 981 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 OGFOD1Q8N543 542 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF417Q8TAU3 575 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 CEP63Q96MT8 703 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PHACTR1Q9C0D0 580 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SPON1Q9HCB6 807 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 BRD7Q9NPI1 651 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.07□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 WASHC2AQ641Q2 1341 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ATP9BO43861 1147 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 AMPHP49418 695 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 LARGE2Q8N3Y3 721 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 CGNL1Q0VF96 1302 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 M0R2N6 131 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZBTB7AO95365 584 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ALBP02768 609 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ADH7P40394 386 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 CDCA8Q53HL2 280 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PRDM6Q9NQX0 595 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 POLKQ9UBT6 870 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 STARD13Q9Y3M8 1113 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 KDRP35968 1356 aa8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SFI1A8K8P3 1242 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ITGB7P26010 798 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 KCNQ4P56696 695 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 TYRO3Q06418 890 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 C8orf86Q6ZUL3 223 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 AMIGO3Q86WK7 504 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SIX5Q8N196 739 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 MICALL1Q8N3F8 863 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 MTFR1LQ9H019 292 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 STK32BQ9NY57 414 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 BRPF3Q9ULD4 1205 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 MRC1P22897 1456 aa8.04□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 IGSF1Q8N6C5 1336 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 FAM229AH3BQW9 127 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 NCLP19338 710 aaKnown RBP8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 ZNF280CQ8ND82 737 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 SUSD3Q96L08 255 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PSMD1Q99460 953 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 PCGF6Q9BYE7 350 aa8.03□□□□□ -1.12
JMJD1C-208ENST00000490669 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 PALLDQ8WX93 1383 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 SYT17Q9BSW7 474 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 DLEC1Q9Y238 1755 aa8.02□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 NRXN2Q9P2S2 1712 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 C21orf2O43822 256 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 NID1P14543 1247 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 BHMTQ93088 406 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 KIF7Q2M1P5 1343 aa8.01□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 DLG5Q8TDM6 1919 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 DKK1O94907 266 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 C20orf204Q6ZNR8 217 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 TEX2Q8IWB9 1127 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 RAPGEF4Q8WZA2 1011 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 NACC1Q96RE7 527 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 PANK3Q9H999 370 aa8□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 PHKG2P15735 406 aa7.99□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa7.99□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 HIF1AQ16665 826 aa7.99□□□□□ -1.13
JMJD1C-208ENST00000490669 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP7.99□□□□□ -1.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32 ms