RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000490302.1

PKDCC-208, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 2

Gene PKDCC, Length 1,447 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-208ENST00000490302 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 PTPRAP18433 802 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 GADL1Q6ZQY3 521 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 GABRQQ9UN88 632 aa21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP21.63■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 AK9Q5TCS8 1911 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 GAKO14976 1311 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB22O15209 634 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 HDAC5Q9UQL6 1122 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa21.62■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC102BQ68D86 513 aa21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 SLF2Q8IX21 1173 aa21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa21.61■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 ADORA1P30542 326 aa21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 MAP3K10Q02779 954 aa21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 ABCF2Q9UG63 623 aa21.6■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 UNC93B1Q9H1C4 597 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 COPRSQ9NQ92 184 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 RFX7Q2KHR2 1363 aa21.59■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 ADCY3O60266 1144 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 BTDP43251 543 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 FLT3LGP49771 235 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 PICALMQ13492 652 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 RASGRF1Q13972 1273 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 NR2E3Q9Y5X4 410 aa21.58■■□□□ 1.05
PKDCC-208ENST00000490302 DOCK2Q92608 1830 aa21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP21.58■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 SGPL1O95470 568 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 SLURP2P0DP57 97 aa21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP21.57■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TRIM75PA6NK02 468 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TIMM10P62072 90 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 PXYLP1Q8TE99 480 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.56■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 INHAP05111 366 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 ELNP15502 786 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 IRF5Q13568 498 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 CAPN2P17655 700 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 ERICH6Q7L0X2 663 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 AKAP2Q9Y2D5 859 aa21.55■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MGAMO43451 1857 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 A0A1B0GUL7 405 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MVPQ14764 893 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 COA7Q96BR5 231 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 XAGE2Q96GT9 111 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MEIS3Q99687 375 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MYH2Q9UKX2 1941 aa21.54■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TBC1D12O60347 775 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TFRCP02786 760 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 RHBDL3P58872 404 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 MECOMQ03112 1051 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 PRO3102Q9H379 93 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 PNMA3Q9UL41 463 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.53■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 DOCK1Q14185 1865 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TFCP2Q12800 502 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 DEFB118Q96PH6 123 aa21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP21.52■■□□□ 1.04
PKDCC-208ENST00000490302 NPM3O75607 178 aaKnown RBP21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 TREML2Q5T2D2 321 aa21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP21.51■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 FAM196BA6NMK8 535 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 EVI5O60447 810 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 LDHCP07864 332 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 GSTO1P78417 241 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 FAM110CQ1W6H9 321 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 NEUROD6Q96NK8 337 aa21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 SRGAP3O43295 1099 aa21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 SPP2Q13103 211 aa21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 ZNF384Q8TF68 577 aa21.49■■□□□ 1.03
PKDCC-208ENST00000490302 PHIPQ8WWQ0 1821 aa21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.8 ms