RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489379.1

EHD1-211, Transcript of EH domain containing 1, humanhuman

TSL 4

Gene EHD1, Length 588 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD1-211ENST00000489379 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.63■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ELP3Q9H9T3 547 aa29.63■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ZNF112Q9UJU3 913 aa29.63■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 TRPA1O75762 1119 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ATP5JP18859 108 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ZFPM1Q8IX07 1006 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 TEX11Q8IYF3 940 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ATRNL1Q5VV63 1379 aa29.62■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ALDH1A1P00352 501 aa29.61■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 PICALMQ13492 652 aa29.61■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 MIGA2Q7L4E1 593 aa29.61■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 OPTNQ96CV9 577 aa29.61■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP29.61■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 FOCADQ5VW36 1801 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 CYP7A1P22680 504 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 MAP3K10Q02779 954 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ERO1BQ86YB8 467 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ANTXR1Q9H6X2 564 aa29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP29.6■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 SPDYE5A6NIY4 337 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 BCL11AQ9H165 835 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 TSKSQ9UJT2 592 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa29.59■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 GPATCH3Q96I76 525 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.58■■■□□ 2.33
EHD1-211ENST00000489379 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D12O60347 775 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 GJA5P36382 358 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 ADGRA1Q86SQ6 560 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 TNS4Q8IZW8 715 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 HAUS7Q99871 368 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 CFHR5Q9BXR6 569 aa29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP29.57■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 GTF2A2P52657 109 aa29.56■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP29.56■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 PAG1Q9NWQ8 432 aa29.56■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 GOLIM4O00461 696 aa29.55■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 PPATQ06203 517 aa29.55■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 IFNL1Q8IU54 200 aa29.55■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 BOLA2Q9H3K6 86 aa29.55■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 ECHDC1Q9NTX5 307 aa29.55■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 INPP5BP32019 993 aa29.54■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP29.54■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP29.54■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 OTUD5Q96G74 571 aa29.54■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 MYH7P12883 1935 aa29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 PPIL2Q13356 520 aa29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 GCC1Q96CN9 775 aa29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 MS4A4AQ96JQ5 239 aa29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP29.53■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.52■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa29.52■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 PI4KBQ9UBF8 816 aa29.52■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP29.52■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP29.52■■■□□ 2.32
EHD1-211ENST00000489379 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 PDE6AP16499 860 aa29.51■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 MYH1P12882 1939 aa29.51■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 FLT1P17948 1338 aa29.5■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 CETPP11597 493 aa29.5■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 SNAPC2Q13487 334 aa29.5■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa29.5■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP29.5■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 SCYL3Q8IZE3 742 aa29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 PICK1Q9NRD5 415 aa29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP29.49■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 DOCK1Q14185 1865 aa29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 TTC41PQ6P2S7 1318 aa29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP29.48■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 IRF6O14896 467 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 TBC1D8O95759 1140 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 USP5P45974 858 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 CCL15Q16663 113 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 IFFO2Q5TF58 517 aa29.47■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 ZNF532Q9HCE3 1301 aa29.46■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 ERC2O15083 957 aa29.46■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 HLA-DOAP06340 250 aa29.46■■■□□ 2.31
EHD1-211ENST00000489379 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.46■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.6 ms