RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CYP26A1O43174 497 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
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RABGGTB-210ENST00000485459 LRRC4CQ9HCJ2 640 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-210ENST00000485459 PARP2Q9UGN5 583 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGGTB-210ENST00000485459 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.54□□□□□ -1.2
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RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF765Q7L2R6 523 aa7.53□□□□□ -1.2
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RABGGTB-210ENST00000485459 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP7.51□□□□□ -1.219e-34■□□□□ 10.3
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RABGGTB-210ENST00000485459 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 VSIG10LQ86VR7 867 aa7.44□□□□□ -1.22
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RABGGTB-210ENST00000485459 BCL2L13Q9BXK5 485 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 MIR1-1HGQ9H1L0 117 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 CCDC39Q9UFE4 941 aa7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 ST13P50502 369 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 IRAK1P51617 712 aa7.43□□□□□ -1.22
RABGGTB-210ENST00000485459 TP53INP2Q8IXH6 220 aa7.43□□□□□ -1.22
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