RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 TTC39AQ5SRH9 613 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 SCYL3Q8IZE3 742 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 TMEM106CQ9BVX2 250 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 KCNH4Q9UQ05 1017 aa24.78■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 SURF6O75683 361 aaKnown RBP24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 GNRH1P01148 92 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 ATP8B2P98198 1209 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP24.77■■□□□ 1.56
ACTB-212ENST00000484841 CXCL11O14625 94 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP24.76■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 ARMC5Q96C12 935 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 ZHX2Q9Y6X8 837 aa24.76■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 POLA2Q14181 598 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PI16Q6UXB8 463 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 GPR108Q9NPR9 543 aa24.75■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 MCAMP43121 646 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 TNNI3KQ59H18 835 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 SSH3Q8TE77 659 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 C1orf115Q9H7X2 142 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 CPA4Q9UI42 421 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 DOCK1Q14185 1865 aa24.74■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PHF20L1A8MW92 1017 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 BAG3O95817 575 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PTPRAP18433 802 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 HOXD10P28358 340 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PRMT2P55345 433 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa24.73■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP24.73■■□□□ 1.552e-7■■□□□ 13.5
ACTB-212ENST00000484841 POTEFA5A3E0 1075 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP24.72■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 C17orf99Q6UX52 265 aa24.72■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 ATRNL1Q5VV63 1379 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 RHBDL3P58872 404 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 CAP1Q01518 475 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 MAP3K10Q02779 954 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 GADL1Q6ZQY3 521 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 TEX11Q8IYF3 940 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 SNRKQ9NRH2 765 aa24.71■■□□□ 1.55
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D12O60347 775 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PLCG2P16885 1265 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PSMC4P43686 418 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 DBNDD2Q9BQY9 259 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa24.7■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZNF384Q8TF68 577 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZNF333Q96JL9 665 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 MAST2Q6P0Q8 1798 aa24.69■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 MS4A1P11836 297 aa24.68■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 TRIM75PA6NK02 468 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 MYCP01106 439 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 MOGSQ13724 837 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 RAET1EQ8TD07 263 aa24.67■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP24.67■■□□□ 1.543e-17■□□□□ 10.5
ACTB-212ENST00000484841 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.67■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 IGSF3O75054 1194 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 CYP2C8P10632 490 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 RLBP1P12271 317 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 EN2P19622 333 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 FCGRTP55899 365 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 GPAT2Q6NUI2 795 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 TRIM34Q9BYJ4 488 aa24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ATAD5Q96QE3 1844 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SLURP2P0DP57 97 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PDE4DIPQ5VU43 2346 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ERC1Q8IUD2 1116 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SH3TC2Q8TF17 1288 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 TBC1D2Q9BYX2 928 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PHIPQ8WWQ0 1821 aa24.65■■□□□ 1.54
ACTB-212ENST00000484841 PTPRFP10586 1907 aa24.65■■□□□ 1.54
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