RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP4CP60510 307 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SREBF2Q12772 1141 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 GPATCH3Q96I76 525 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PCNTO95613 3336 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TSKSQ9UJT2 592 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TRPA1O75762 1119 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 TM4SF4P48230 202 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 INHBEP58166 350 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 VGLL4Q14135 290 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 OPTNQ96CV9 577 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ECHDC1Q9NTX5 307 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 PAG1Q9NWQ8 432 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF186Q9NXI6 227 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 OTOFQ9HC10 1997 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 ADGRA1Q86SQ6 560 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 CERS3Q8IU89 383 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 HAUS7Q99871 368 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 SAGE1Q9NXZ1 904 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 DOCK2Q92608 1830 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 RFX7Q2KHR2 1363 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP4-209ENST00000484097 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 EXOC6Q8TAG9 804 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GCC1Q96CN9 775 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 MIGA1Q8NAN2 632 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF112Q9UJU3 913 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 INPP5BP32019 993 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ANKRD45Q5TZF3 282 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ERO1BQ86YB8 467 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OTUD5Q96G74 571 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP23.37■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE6AP16499 860 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GJA5P36382 358 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 USP5P45974 858 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 SPDYE5A6NIY4 337 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ALDH1A1P00352 501 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ATRNL1Q5VV63 1379 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZNF532Q9HCE3 1301 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D12O60347 775 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 GTF2A2P52657 109 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K10Q02779 954 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PI4KBQ9UBF8 816 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ERC2O15083 957 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 PPATQ06203 517 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 IFNL1Q8IU54 200 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP4-209ENST00000484097 FLT1P17948 1338 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.33■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 PHF20L1A8MW92 1017 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TNS4Q8IZW8 715 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 PICK1Q9NRD5 415 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 FOCADQ5VW36 1801 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D8O95759 1140 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 HLA-DOAP06340 250 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 ADD2P35612 726 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 PPIL2Q13356 520 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TSHZ3Q63HK5 1081 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SCYL3Q8IZE3 742 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP23.31■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH1P12882 1939 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MYH7P12883 1935 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SLURP2P0DP57 97 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 SNAPC2Q13487 334 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 CCL15Q16663 113 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 FOXP4Q8IVH2 680 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP23.3■■□□□ 1.32
SH3BP4-209ENST00000484097 MS4A4AQ96JQ5 239 aa23.3■■□□□ 1.32
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