RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 LRP2BPQ9P2M1 347 aa29.37■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 LDHCP07864 332 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 INPP5BP32019 993 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 ZAP70P43403 619 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 OTUD5Q96G74 571 aa29.36■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 ERO1BQ86YB8 467 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP29.35■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 BRI3BPQ8WY22 251 aa29.35■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
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PTPRD-210ENST00000481079 IL1RAPL2Q9NP60 686 aa29.34■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP29.34■■■□□ 2.29
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PTPRD-210ENST00000481079 PICALMQ13492 652 aa29.33■■■□□ 2.29
PTPRD-210ENST00000481079 PHF20L1A8MW92 1017 aa29.32■■■□□ 2.28
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PTPRD-210ENST00000481079 IRF6O14896 467 aa29.31■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 SLURP2P0DP57 97 aa29.31■■■□□ 2.28
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PTPRD-210ENST00000481079 CCL15Q16663 113 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa29.3■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 PPATQ06203 517 aa29.29■■■□□ 2.28
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PTPRD-210ENST00000481079 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa29.29■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP29.29■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 APBB1O00213 710 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 FKTNO75072 461 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 PPP4CP60510 307 aa29.28■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP29.28■■■□□ 2.28
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PTPRD-210ENST00000481079 RAB11FIP3O75154 756 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 FAM43AQ8N2R8 423 aa29.27■■■□□ 2.28
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PTPRD-210ENST00000481079 HTTP42858 3142 aa29.27■■■□□ 2.28
PTPRD-210ENST00000481079 TEX11Q8IYF3 940 aa29.26■■■□□ 2.27
PTPRD-210ENST00000481079 CLASRPQ8N2M8 674 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.27
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PTPRD-210ENST00000481079 CETPP11597 493 aa29.25■■■□□ 2.27
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PTPRD-210ENST00000481079 DOCK1Q14185 1865 aa29.22■■■□□ 2.27
PTPRD-210ENST00000481079 PLCG2P16885 1265 aa29.21■■■□□ 2.27
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PTPRD-210ENST00000481079 FAM196BA6NMK8 535 aa29.2■■■□□ 2.26
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PTPRD-210ENST00000481079 MAGEB6Q8N7X4 407 aa29.19■■■□□ 2.26
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PTPRD-210ENST00000481079 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP29.17■■■□□ 2.26
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PTPRD-210ENST00000481079 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP29.16■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 MIGA1Q8NAN2 632 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 HPS5Q9UPZ3 1129 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 PTPRFP10586 1907 aa29.16■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP29.15■■■□□ 2.26
PTPRD-210ENST00000481079 ANKRD23Q86SG2 305 aa29.15■■■□□ 2.26
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