RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472045.1

IRF1-208, Transcript of interferon regulatory factor 1, human

TSL 2

Gene IRF1, Length 5,153 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IRF1-208	ENST00000472045	GRAPL	Q8TC17	118 aa	Predicted RBP	13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ATG3	Q9NT62	314 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CIAO1	O76071	339 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CFB	P00751	764 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SUPT20HL1	Q3ZLR7	823 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SPC25	Q9HBM1	224 aa		13.93	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	DKC1	O60832	514 aa	Known RBP eCLIP	13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	TAOK3	Q9H2K8	898 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SGSM2	O43147	1006 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	F13A1	P00488	732 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CIAPIN1	Q6FI81	312 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC172	P0C7W6	258 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PHKA1	P46020	1223 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	EAF2	Q96CJ1	260 aa	Predicted RBP	13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	COPRS	Q9NQ92	184 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CPA1	P15085	419 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PPP2R5B	Q15173	497 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	USP26	Q9BXU7	913 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	AZI2	Q9H6S1	392 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SYNC	Q9H7C4	482 aa		13.92	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	UNC13B	O14795	1591 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	MACROD2	A1Z1Q3	448 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	C21orf2	O43822	256 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ARHGEF6	Q15052	776 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SEPT7	Q16181	437 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	GLI2	P10070	1586 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CPSF1	Q10570	1443 aa	Known RBP	13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	N4BP3	O15049	544 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ICA1	Q05084	483 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF174	Q15697	407 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	TBC1D5	Q92609	795 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		13.91	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PPM1F	P49593	454 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CCT6A	P40227	531 aa	Known RBP	13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PIK3AP1	Q6ZUJ8	805 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SPAG5	Q96R06	1193 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	ZSCAN12	O43309	604 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CTNNA2	P26232	953 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	CSRNP1	Q96S65	589 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	PLIN2	Q99541	437 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	MYL10	Q9BUA6	226 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	GINS2	Q9Y248	185 aa		13.9	□□□□□ -0.18
IRF1-208	ENST00000472045	GOLGA6L10	A6NI86	522 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CCNT1	O60563	726 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ZNF165	P49910	485 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	COL15A1	P39059	1388 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CEP152	O94986	1710 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CDC42BPB	Q9Y5S2	1711 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	RILPL1	Q5EBL4	403 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	HAUS7	Q99871	368 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	KCNQ2	O43526	872 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	NONO	Q15233	471 aa	Known RBP eCLIP	13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	TAF12	Q16514	161 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		13.89	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	PTCH1	Q13635	1447 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	PSD	A5PKW4	1024 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	DDX39A	O00148	427 aa	Known RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	KIF4A	O95239	1232 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	TNNT1	P13805	278 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ADORA1	P30542	326 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	IQUB	Q8NA54	791 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	SPON1	Q9HCB6	807 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	USP17L3	A6NCW0	530 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	USP17L4	A6NCW7	530 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CAVIN2	O95810	425 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	SPAG1	Q07617	926 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	USP17L1	Q7RTZ2	530 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	GPR108	Q9NPR9	543 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	ALAS1	P13196	640 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	SNX21	Q969T3	373 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	FLOT1	O75955	427 aa		13.88	□□□□□ -0.19
IRF1-208	ENST00000472045	IFT74	Q96LB3	600 aa		13.88	□□□□□ -0.19

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