RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468693.5

HCLS1-204, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, human

TSL 3

Gene HCLS1, Length 502 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HCLS1-204	ENST00000468693	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HCLS1-204	ENST00000468693	AK9	Q5TCS8	1911 aa		14.03	□□□□□ -0.16
HCLS1-204	ENST00000468693	CYP2B6	P20813	491 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	RTP1	P59025	263 aa		14.02	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TMPO	P42166	694 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	GYG1	P46976	350 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC85B	Q15834	202 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	APOBEC3H	Q6NTF7	200 aa	Known RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TEKT1	Q969V4	418 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FRMPD3	Q5JV73	1810 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PIEZO1	Q92508	2521 aa		14.01	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PTPRF	P10586	1907 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PLIN1	O60240	522 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	DNAJB2	P25686	324 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	MRE11	P49959	708 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	LMOD3	Q0VAK6	560 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TREML2	Q5T2D2	321 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ZDHHC15	Q96MV8	337 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF576	Q9H609	170 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ATP11B	Q9Y2G3	1177 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		14	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693		H7C1W4	665 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CSF1R	P07333	972 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PTPRA	P18433	802 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TCP10	Q12799	353 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TMEM31	Q5JXX7	168 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FRMD4A	Q9P2Q2	1039 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		13.99	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM86C2P	A6NEL3	165 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM75P	A6NK02	468 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	NEURL1B	A8MQ27	555 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	EPHB4	P54760	987 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	HDLBP	Q00341	1268 aa	Known RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	NEUROD2	Q15784	382 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	SCYL3	Q8IZE3	742 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM151A	Q8WW52	585 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PLA2G12B	Q9BX93	195 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	C11orf16	Q9NQ32	467 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.98	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ATXN8OS	P0DMR3	200 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	BMP1	P13497	986 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	HIBADH	P31937	336 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CCL14	Q16627	93 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CCDC84	Q86UT8	332 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM84B	Q96KN1	310 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	GAS2L1	Q99501	681 aa	Predicted RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PRDM12	Q9H4Q4	367 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PICK1	Q9NRD5	415 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		13.97	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PEX10	O60683	326 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	CASP7	P55210	303 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	NFIA	Q12857	509 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	ADGRE1	Q14246	886 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	TIFA	Q96CG3	184 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	NCOR1	O75376	2440 aa		13.96	□□□□□ -0.17
HCLS1-204	ENST00000468693	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	SLURP2	P0DP57	97 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TFF2	Q03403	129 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	PNMA3	Q9UL41	463 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM35	Q9UPQ4	493 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		13.95	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	ITGB8	P26012	769 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	KCNQ1	P51787	676 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	TRIM60	Q495X7	471 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	ZFPM1	Q8IX07	1006 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.94	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	IFIT5	Q13325	482 aa	Known RBP	13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CHMP3	Q9Y3E7	222 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	REV3L	O60673	3130 aa		13.93	□□□□□ -0.18
HCLS1-204	ENST00000468693	CACNA1A	O00555	2505 aa		13.93	□□□□□ -0.18

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