RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466252.5

SNX21-208, Transcript of sorting nexin family member 21, human

TSL 3

Gene SNX21, Length 574 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SNX21-208	ENST00000466252	CDK5RAP2	Q96SN8	1893 aa		27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	CERS3	Q8IU89	383 aa		27.87	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	MAP3K10	Q02779	954 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	PICALM	Q13492	652 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	ZSCAN25	Q6NSZ9	544 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	RGMB	Q6NW40	437 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		27.86	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	MAGEB6P1	A0A0J9YX57	407 aa		27.85	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	27.85	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	UNCX	A6NJT0	531 aa		27.84	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	27.84	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	FAM155A	B1AL88	458 aa	Predicted RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	RNF113A	O15541	343 aa	Known RBP	27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	JMY	Q8N9B5	988 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	HOOK2	Q96ED9	719 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	CAPNS2	Q96L46	248 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		27.83	■■■□□ 2.05
SNX21-208	ENST00000466252	NEFL	P07196	543 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	EVI5L	Q96CN4	794 aa		27.82	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	27.82	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ECE1	P42892	770 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF157	P51786	506 aa	Predicted RBP	27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC102A	Q96A19	550 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF112	Q9UJU3	913 aa		27.81	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	SLURP2	P0DP57	97 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	MAP3K9	P80192	1104 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	CENPQ	Q7L2Z9	268 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZSCAN29	Q8IWY8	852 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	LCORL	Q8N3X6	602 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	OSBP2	Q969R2	916 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	CSRNP1	Q96S65	589 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ARMT1	Q9H993	441 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	FLT1	P17948	1338 aa		27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	27.8	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	TBC1D12	O60347	775 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	DCAF15	Q66K64	600 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ANKRD13A	Q8IZ07	590 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	APPBP2	Q92624	585 aa		27.79	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	SLC10A3	P09131	477 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ERICH6B	Q5W0A0	696 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	TICAM2	Q86XR7	235 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	27.78	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	MBD4	O95243	580 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	MAP2K2	P36507	400 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	METTL16	Q86W50	562 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	RASAL3	Q86YV0	1011 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	SLC10A4	Q96EP9	437 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	ZIC5	Q96T25	663 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	FSD1	Q9BTV5	496 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	CRNKL1	Q9BZJ0	848 aa	Known RBP	27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PALD1	Q9ULE6	856 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	MYH1	P12882	1939 aa		27.77	■■■□□ 2.04
SNX21-208	ENST00000466252	PRKAB2	O43741	272 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	AOC2	O75106	756 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	USP5	P45974	858 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	LRRFIP1	Q32MZ4	808 aa	Known RBP	27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	ZMYM1	Q5SVZ6	1142 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		27.76	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	27.75	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		27.75	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	NOG	Q13253	232 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	GRM1	Q13255	1194 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SEC62	Q99442	399 aa	Known RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	27.74	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	INPP5B	P32019	993 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	VGLL4	Q14135	290 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	AIDA	Q96BJ3	306 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	WRNIP1	Q96S55	665 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SAP30BP	Q9UHR5	308 aa	Known RBP	27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SIPA1L1	O43166	1804 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	OTOF	Q9HC10	1997 aa		27.73	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	TRIM6-TRIM34	B2RNG4	842 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252		M0R2C6	588 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SPRYD7	Q5W111	196 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	RILPL2	Q969X0	211 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		27.72	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	27.71	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	27.71	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		27.71	■■■□□ 2.03
SNX21-208	ENST00000466252	FAM196B	A6NMK8	535 aa		27.7	■■■□□ 2.02
SNX21-208	ENST00000466252	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	27.7	■■■□□ 2.02
SNX21-208	ENST00000466252	GJA5	P36382	358 aa		27.7	■■■□□ 2.02

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