RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464710.1

IL6-208, Transcript of interleukin 6, human

TSL 4

Gene IL6, Length 582 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
IL6-208	ENST00000464710	SCN4A	P35499	1836 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PSME4	Q14997	1843 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710		A0A0D9SFI3	127 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CDC45	O75419	566 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	WDHD1	O75717	1129 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ITGBL1	O95965	494 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FSTL1	Q12841	308 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FAM83A	Q86UY5	434 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	AMOTL1	Q8IY63	956 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CDCA5	Q96FF9	252 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TRIM34	Q9BYJ4	488 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MCM9	Q9NXL9	1143 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PALD1	Q9ULE6	856 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PPP2R3B	Q9Y5P8	575 aa		10.01	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MINDY4B	A8MYZ0	360 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CELF2	O95319	508 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	HLA-DOA	P06340	250 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TDO2	P48775	406 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MIGA2	Q7L4E1	593 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TTC6	Q86TZ1	520 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	IFNL3	Q8IZI9	196 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	C2orf69	Q8N8R5	385 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	HOOK2	Q96ED9	719 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ATP8A2	Q9NTI2	1148 aa		10	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	DDTL	A6NHG4	134 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	USP17L12	C9JPN9	530 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	USP17L21	D6R901	530 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PPP1R12B	O60237	982 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FOXP4	Q8IVH2	680 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CRACR2B	Q8N4Y2	399 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CSRNP1	Q96S65	589 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	NAPB	Q9H115	298 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	DHX36	Q9H2U1	1008 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	XPO5	Q9HAV4	1204 aa	Known RBP eCLIP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PI4KB	Q9UBF8	816 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FLT1	P17948	1338 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CCDC171	Q6TFL3	1326 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CNTNAP1	P78357	1384 aa		9.99	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	NPM3	O75607	178 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	HSPD1	P10809	573 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	VPS53	Q5VIR6	699 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	DCAF15	Q66K64	600 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	SH3BP5L	Q7L8J4	393 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ARMC9	Q7Z3E5	817 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ZNF589	Q86UQ0	364 aa	Predicted RBP	9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	TEPSIN	Q96N21	525 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	FZD1	Q9UP38	647 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	RFX7	Q2KHR2	1363 aa		9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MYO5A	Q9Y4I1	1855 aa	Known RBP	9.98	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	SGSM2	O43147	1006 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CYP2D6	P10635	497 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	PLCD1	P51178	756 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CST9	Q5W186	159 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CTR9	Q6PD62	1173 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	MOB2	Q70IA6	237 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	9.97	□□□□□ -0.81
IL6-208	ENST00000464710	CYP2D7	A0A087X1C5	515 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	FAM196B	A6NMK8	535 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	ZNF213	O14771	459 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	FGA	P02671	866 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	SLURP2	P0DP57	97 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	IREB2	P48200	963 aa	Known RBP	9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	C1QTNF8	P60827	252 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	PAXIP1	Q6ZW49	1069 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	MKNK2	Q9HBH9	465 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	ARPP21	Q9UBL0	812 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	RAD50	Q92878	1312 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		9.96	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	POLR2A	P24928	1970 aa	Known RBP	9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	APLP1	P51693	650 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	HAND2	P61296	217 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	MAP3K9	P80192	1104 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	PTH1R	Q03431	593 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	CTDSPL2	Q05D32	466 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	ALX1	Q15699	326 aa		9.95	□□□□□ -0.82
IL6-208	ENST00000464710	SBK1	Q52WX2	424 aa		9.95	□□□□□ -0.82

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