RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463118.1

AKAP9-208, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, human

TSL 3

Gene AKAP9, Length 891 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP9-208	ENST00000463118	TTLL5	Q6EMB2	1281 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	CLSTN2	Q9H4D0	955 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	RCOR1	Q9UKL0	485 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		13.42	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	GPAA1	O43292	621 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	OFD1	O75665	1012 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	GIMAP6	Q6P9H5	292 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	KCNK17	Q96T54	332 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	PHLPP1	O60346	1717 aa		13.41	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	TCRBV5S4A2T	A0A5A2	114 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	PRC1	O43663	620 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	AP1G2	O75843	785 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	CAMTA2	O94983	1202 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	DDB1	Q16531	1140 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC102B	Q68D86	513 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	NCOA7	Q8NI08	942 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	PGBD1	Q96JS3	809 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	PIH1D3	Q9NQM4	214 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		13.4	□□□□□ -0.26
AKAP9-208	ENST00000463118	SPATA31A5	Q5VU36	1347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SPATA31A7	Q8IWB4	1347 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	DOCK2	Q92608	1830 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	C3orf80	F5H4A9	247 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF213	O14771	459 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC5A1	P13866	664 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PDE6A	P16499	860 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	NDUFV2	P19404	249 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CRKL	P46109	303 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TERF1	P54274	439 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ANTXR2	P58335	489 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PI16	Q6UXB8	463 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SMARCC1	Q92922	1105 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.39	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SMAP	O00193	183 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ADCY5	O95622	1261 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CAVIN2	O95810	425 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	FDPS	P14324	419 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PHKA1	P46020	1223 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TYRO3	Q06418	890 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PROX2	Q3B8N5	592 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SLC9C2	Q5TAH2	1124 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PDZRN4	Q6ZMN7	1036 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	MARCH10	Q8NA82	808 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	FAM200A	Q8TCP9	573 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	NBPF3	Q9H094	633 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	DACT1	Q9NYF0	836 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	HPS5	Q9UPZ3	1129 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	COL5A3	P25940	1745 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TIAM2	Q8IVF5	1701 aa		13.38	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CTAGE5	O15320	804 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	NTSR2	O95665	410 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	GCGR	P47871	477 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SIK1	P57059	783 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CCT2	P78371	535 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ITPK1	Q13572	414 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	QPCT	Q16769	361 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CCDC152	Q4G0S7	254 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TNMD	Q9H2S6	317 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PLSCR2	Q9NRY7	297 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	USP25	Q9UHP3	1055 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	MRVI1	Q9Y6F6	885 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ZNF532	Q9HCE3	1301 aa		13.37	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	C4A	P0C0L4	1744 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	C4B	P0C0L5	1744 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	KLF18	A0A0U1RQI7	1052 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	ATP6V1A	P38606	617 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	HAND2	P61296	217 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SPATA5	Q8NB90	893 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	RTEL1	Q9NZ71	1219 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	KIAA1468	Q9P260	1216 aa		13.36	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	GOLGA8B	A8MQT2	603 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	NR1I2	O75469	434 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TPM3	P06753	285 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	TRDN	Q13061	729 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		13.35	□□□□□ -0.27
AKAP9-208	ENST00000463118	CHST3	Q7LGC8	479 aa		13.35	□□□□□ -0.27

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