RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 TTC39AQ5SRH9 613 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM57Q8N5G2 664 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SPATA5Q8NB90 893 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 BCL11AQ9H165 835 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SNRKQ9NRH2 765 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 HMG20BQ9P0W2 317 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF112Q9UJU3 913 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MGAMO43451 1857 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SLURP2P0DP57 97 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 HOXD10P28358 340 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 PSMC4P43686 418 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 PI16Q6UXB8 463 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD23Q86SG2 305 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ITPRIPQ8IWB1 547 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MIER1Q8N108 512 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 C1orf115Q9H7X2 142 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM75PA6NK02 468 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SURF6O75683 361 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 CYP2C8P10632 490 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 MTX1Q13505 466 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC158Q5M9N0 1113 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 TEX11Q8IYF3 940 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 SCYL3Q8IZE3 742 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 RAET1EQ8TD07 263 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ARMC5Q96C12 935 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 IDI2Q9BXS1 227 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 TAOK2Q9UL54 1235 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 ATAD5Q96QE3 1844 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 GAKO14976 1311 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 DOCK1Q14185 1865 aa10.53□□□□□ -0.72
SH3BP1-204ENST00000459646 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM196BA6NMK8 535 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CXCL11O14625 94 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 C17orf99Q6UX52 265 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF333Q96JL9 665 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM34Q9BYJ4 488 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 KCNH4Q9UQ05 1017 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPRFP10586 1907 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF20L1A8MW92 1017 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 BAG3O95817 575 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 GNRH1P01148 92 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPRAP18433 802 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MCAMP43121 646 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 ATP8B2P98198 1209 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 TRIM47Q96LD4 638 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 AATFQ9NY61 560 aaKnown RBP eCLIP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MYPNQ86TC9 1320 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PHIPQ8WWQ0 1821 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 OSBPP22059 807 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PRMT2P55345 433 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 FCGRTP55899 365 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 TNNI3KQ59H18 835 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 GPAT2Q6NUI2 795 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 DBNDD2Q9BQY9 259 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SRRDQ9UH36 339 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MYH1P12882 1939 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CTGFP29279 349 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 GRK4P32298 578 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 RHBDL3P58872 404 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 SPP2Q13103 211 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MOGSQ13724 837 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MTFR1Q15390 333 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 CRACR2BQ8N4Y2 399 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF384Q8TF68 577 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP1-204ENST00000459646 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa10.49□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.2 ms