RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436996.1

TTC28-AS1-215, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene TTC28-AS1, Length 662 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TEX11Q8IYF3 940 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LCORLQ8N3X6 602 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MRIQ9BWK5 157 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TMOD2Q9NZR1 351 aa11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTC41PQ6P2S7 1318 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SMIM22K7EJ46 135 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GSTO1P78417 241 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNFAIP1Q13829 316 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GPATCH3Q96I76 525 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CAPNS2Q96L46 248 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa11.43□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM155AB1AL88 458 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 M0R2C6 588 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PRKAB2O43741 272 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MBD4O95243 580 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GJA5P36382 358 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP3K12Q12852 859 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MIGA2Q7L4E1 593 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM83AQ86UY5 434 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM151AQ8WW52 585 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 IDI2Q9BXS1 227 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARMT1Q9H993 441 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 STAP2Q9UGK3 403 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MYH4Q9Y623 1939 aa11.42□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP2O75604 605 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLC10A3P09131 477 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP2D6P10635 497 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 INPP5BP32019 993 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TNNI2P48788 182 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DEFB115Q30KQ5 88 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FKBP1CQ5VVH2 108 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SLF2Q8IX21 1173 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 C2orf69Q8N8R5 385 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 KBTBD3Q8NAB2 608 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SDR42E1Q8WUS8 393 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DNAJC18Q9H819 358 aa11.41□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PARP14Q460N5 1801 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LDHCP07864 332 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NF2P35240 595 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP4CP60510 307 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 VGLL4Q14135 290 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RGMBQ6NW40 437 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 OSBP2Q969R2 916 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CSRNP1Q96S65 589 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FSD1Q9BTV5 496 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ELP3Q9H9T3 547 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa11.4□□□□□ -0.58
TTC28-AS1-215ENST00000436996 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ENTPD3O75355 529 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 MAP3K11Q16584 847 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 WRNIP1Q96S55 665 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 PALD1Q9ULE6 856 aa11.39□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 A0A0D9SFI3 127 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ERC2O15083 957 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JAG1P78504 1218 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 ARMC9Q7Z3E5 817 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 JMYQ8N9B5 988 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FAM227BQ96M60 508 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF39Q9H2S5 420 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 TSKSQ9UJT2 592 aa11.38□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FOXP2O15409 715 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 BAG3O95817 575 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 USP5P45974 858 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 FKBP1BP68106 108 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 UBE3CQ15386 1083 aa11.37□□□□□ -0.59
TTC28-AS1-215ENST00000436996 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa11.37□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 79.5 ms