RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430766.1

PTPRD-AS1-201, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRD-AS1, Length 1,959 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FPGSQ05932 587 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RALYQ9UKM9 306 aaKnown RBP11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRPC6Q9Y210 931 aa11.46□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KMT2EQ8IZD2 1858 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CDCA8Q53HL2 280 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RASIP1Q5U651 963 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC28A3Q9HAS3 691 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRR23AA6NEV1 266 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DNM1LO00429 736 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CACNB2Q08289 660 aaPredicted RBP11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIM60Q495X7 471 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NKX2-4Q9H2Z4 354 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.45□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRIOO75962 3097 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GAKO14976 1311 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TECTAO75443 2155 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PKN1Q16512 942 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DMDP11532 3685 aa11.44□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOWAHBA6NEL2 793 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BMP8AQ7Z5Y6 402 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM39BQ9GZU3 492 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM110CQ1W6H9 321 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C1orf53Q5VUE5 145 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TACC3Q9Y6A5 838 aa11.43□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GTF2IP78347 998 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TRMT44Q8IYL2 757 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RNF39Q9H2S5 420 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DMXL1Q9Y485 3027 aa11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KIAA0355O15063 1070 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CERS5Q8N5B7 392 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CXCL11O14625 94 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LPAR1Q92633 364 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SEC31BQ9NQW1 1179 aa11.41□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RAG1P15918 1043 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CYP2B6P20813 491 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TNNI2P48788 182 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LRP10Q7Z4F1 713 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RMDN1Q96DB5 314 aa11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP11.4□□□□□ -0.58
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CLTBP09497 229 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PTPRFP10586 1907 aa11.39□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DSG3P32926 999 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TLE2Q04725 743 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TMEM240Q5SV17 173 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TXNRD3Q86VQ6 643 aa11.38□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TCP10L2B9ZVM9 353 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 MSCO60682 206 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCDC174Q6PII3 467 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 HOOK2Q96ED9 719 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FAM89AQ96GI7 184 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 F8W031 263 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 INPP5BP32019 993 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 LEXMQ3ZCV2 418 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PPP2R2DQ66LE6 453 aa11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 IL9P15248 144 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ZNF521Q96K83 1311 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SLC5A1P13866 664 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NBL1P41271 181 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 DCAF15Q66K64 600 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 C16orf59Q7L2K0 433 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 SOCS4Q8WXH5 440 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 FSD1Q9BTV5 496 aa11.36□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 CCT4P50991 539 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 EPHA10Q5JZY3 1008 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 KRT40Q6A162 431 aa11.35□□□□□ -0.59
PTPRD-AS1-201ENST00000430766 ADSSL1Q8N142 457 aa11.35□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 13.2 ms