RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000430175.5

DUSP18-208, Transcript of dual specificity phosphatase 18, human

TSL 3

Gene DUSP18, Length 598 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
DUSP18-208	ENST00000430175	PFAS	O15067	1338 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	COL6A1	P12109	1028 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	GADL1	Q6ZQY3	521 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TSPYL6	Q8N831	410 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	FAM161B	Q96MY7	647 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	LBHD1	Q9BQE6	289 aa	Predicted RBP	10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PICK1	Q9NRD5	415 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		10.88	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MROH5	Q6ZUA9	1318 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	CUL9	Q8IWT3	2517 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TNFRSF10A	O00220	468 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PTPRA	P18433	802 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	FLII	Q13045	1269 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	CHAF1A	Q13111	956 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	G2E3	Q7L622	706 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TRMT44	Q8IYL2	757 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	ANKRD13C	Q8N6S4	541 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	ZNF594	Q96JF6	807 aa	Predicted RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	SEMA6B	Q9H3T3	888 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	GJD2	Q9UKL4	321 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	10.87	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PLA2G5	P39877	138 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MKRN4P	Q13434	485 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	10.86	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MAP3K21	Q5TCX8	1036 aa		10.86	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TCP10	Q12799	353 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PABPC4	Q13310	644 aa	Known RBP eCLIP	10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PROCA1	Q8NCQ7	364 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	FAM122A	Q96E09	287 aa		10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	IQSEC3	Q9UPP2	1182 aa	Predicted RBP	10.85	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	KIF16B	Q96L93	1317 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TMEM265	A0A087WTH1	108 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	CTNND1	O60716	968 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	SMAD3	P84022	425 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	MAP3K10	Q02779	954 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TRIM32	Q13049	653 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	LRRC26	Q2I0M4	334 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	CDC42EP5	Q6NZY7	148 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	TRIB2	Q92519	343 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	PRKAG2	Q9UGJ0	569 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	AK9	Q5TCS8	1911 aa		10.84	□□□□□ -0.67
DUSP18-208	ENST00000430175	ATRNL1	Q5VV63	1379 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	APAF1	O14727	1248 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	ENTPD3	O75355	529 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PRKAR2A	P13861	404 aa	Known RBP	10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	FOSL2	P15408	326 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	BEND3	Q5T5X7	828 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	TBC1D2	Q9BYX2	928 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	FAM198A	Q9UFP1	575 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	DAGLA	Q9Y4D2	1042 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PTPRF	P10586	1907 aa		10.83	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	GRM8	O00222	908 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PDE8B	O95263	885 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	NFIA	Q12857	509 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	IDI2	Q9BXS1	227 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PUS3	Q9BZE2	481 aa	Known RBP	10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	MORF4L1	Q9UBU8	362 aa		10.82	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	DOCK2	Q92608	1830 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	LAMA3	Q16787	3333 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	CACNA1F	O60840	1977 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	DOCK1	Q14185	1865 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	TRIM75P	A6NK02	468 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	CYP2B6	P20813	491 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	ZEB1	P37275	1124 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	TREML2	Q5T2D2	321 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	LHX8	Q68G74	356 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	USP40	Q9NVE5	1235 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PHIP	Q8WWQ0	1821 aa		10.81	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	PLXNB2	O15031	1838 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	TBC1D12	O60347	775 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	IFIT1	P09914	478 aa	Known RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	ZKSCAN1	P17029	563 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	SHH	Q15465	462 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	METTL24	Q5JXM2	366 aa		10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	TTYH1	Q9H313	450 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	ARIH1	Q9Y4X5	557 aa	Predicted RBP	10.8	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	MSC	O60682	206 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	ALDH1L1	O75891	902 aa		10.79	□□□□□ -0.68
DUSP18-208	ENST00000430175	MAPK4	P31152	587 aa		10.79	□□□□□ -0.68

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