RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428678.1

UPK3BP1-201, Transcript of uroplakin 3B pseudogene 1, humanhuman

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Gene UPK3BP1, Length 509 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPK3BP1-201ENST00000428678 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.79■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 GABRQQ9UN88 632 aa22.79■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPRAP18433 802 aa22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ENTPD3O75355 529 aa22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 IDI2Q9BXS1 227 aa22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.77■■□□□ 1.24
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADCY3O60266 1144 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ADORA1P30542 326 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 IL15P40933 162 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 PTPRFP10586 1907 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 GAKO14976 1311 aa22.76■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 DOCK1Q14185 1865 aa22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC102BQ68D86 513 aa22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ABCF2Q9UG63 623 aa22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 NR2E3Q9Y5X4 410 aa22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.75■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLURP2P0DP57 97 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ELNP15502 786 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 FLT3LGP49771 235 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLFN5Q08AF3 891 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 PICALMQ13492 652 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 RASGRF1Q13972 1273 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLF2Q8IX21 1173 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa22.74■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP22.73■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 TRIM75PA6NK02 468 aa22.73■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP22.73■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.73■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SGPL1O95470 568 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 INHAP05111 366 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 BTDP43251 543 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 FRMD4AQ9P2Q2 1039 aaPredicted RBP22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 TAOK2Q9UL54 1235 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 HDAC5Q9UQL6 1122 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.72■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 MAP3K10Q02779 954 aa22.71■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 TFRCP02786 760 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 TIMM10P62072 90 aa22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 COPRSQ9NQ92 184 aa22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa22.7■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZBTB22O15209 634 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 IRF5Q13568 498 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 CDCA7LQ96GN5 454 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 DEFB118Q96PH6 123 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 LAMA3Q16787 3333 aa22.69■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 EVI5O60447 810 aa22.68■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 COA7Q96BR5 231 aa22.68■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 PRO3102Q9H379 93 aa22.68■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 PNMA3Q9UL41 463 aa22.68■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM196BA6NMK8 535 aa22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 MECOMQ03112 1051 aa22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 TREML2Q5T2D2 321 aa22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 ERICH6Q7L0X2 663 aa22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 MEIS3Q99687 375 aa22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.67■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A1B0GUL7 405 aa22.66■■□□□ 1.22
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UPK3BP1-201ENST00000428678 XAGE2Q96GT9 111 aa22.66■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 AKAP2Q9Y2D5 859 aa22.66■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa22.65■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 RHBDL3P58872 404 aa22.65■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 TFCP2Q12800 502 aa22.65■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 FAM110CQ1W6H9 321 aa22.65■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
UPK3BP1-201ENST00000428678 TBC1D12O60347 775 aa22.64■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 CAPN2P17655 700 aa22.64■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 SPP2Q13103 211 aa22.64■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 ZNF384Q8TF68 577 aa22.64■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 A0A0C4DFX4 3053 aa22.63■■□□□ 1.21
UPK3BP1-201ENST00000428678 SRGAP3O43295 1099 aa22.63■■□□□ 1.21
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