RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 FOXP2O15409 715 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 TDO2P48775 406 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 DSCC1Q9BVC3 393 aa24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 TCP10Q12799 353 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 IFNL3Q8IZI9 196 aa24.62■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 NAPBQ9H115 298 aa24.62■■□□□ 1.53
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HOXA4-202ENST00000428284 TNFAIP1Q13829 316 aa24.61■■□□□ 1.53
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HOXA4-202ENST00000428284 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 FAM198AQ9UFP1 575 aa24.61■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP24.61■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 GIMAP6Q6P9H5 292 aa24.6■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
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HOXA4-202ENST00000428284 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 NPM3O75607 178 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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HOXA4-202ENST00000428284 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
HOXA4-202ENST00000428284 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
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HOXA4-202ENST00000428284 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa24.58■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP24.58■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 CNTNAP1P78357 1384 aa24.58■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 ALX1Q15699 326 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 ZFPM1Q8IX07 1006 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 PALD1Q9ULE6 856 aa24.57■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 SIPA1L1O43166 1804 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 USP17L12C9JPN9 530 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 USP17L21D6R901 530 aa24.56■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 RASA3Q14644 834 aa24.56■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 TMEM39BQ9GZU3 492 aa24.56■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa24.54■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 CYP2D6P10635 497 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 KRT26Q7Z3Y9 468 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 LDHDQ86WU2 507 aa24.54■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 PGAP2Q9UHJ9 254 aa24.54■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 HLA-DOAP06340 250 aa24.53■■□□□ 1.52
HOXA4-202ENST00000428284 HAND2P61296 217 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 TTC6Q86TZ1 520 aa24.53■■□□□ 1.52
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HOXA4-202ENST00000428284 C12orf60Q5U649 245 aa24.51■■□□□ 1.51
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HOXA4-202ENST00000428284 USP48Q86UV5 1035 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 STK11IPQ8N1F8 1099 aa24.5■■□□□ 1.51
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HOXA4-202ENST00000428284 PI4KBQ9UBF8 816 aa24.5■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 SMIM22K7EJ46 135 aa24.49■■□□□ 1.51
HOXA4-202ENST00000428284 SLC27A2O14975 620 aa24.49■■□□□ 1.51
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