RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419504.5

TNS1-205, Transcript of tensin 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene TNS1, Length 5,921 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-205ENST00000419504 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 FAM169AQ9Y6X4 670 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IQCDQ96DY2 449 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 GNPATO15228 680 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 MNAT1P51948 309 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 LIN9Q5TKA1 542 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 MLKLQ8NB16 471 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 GGA1Q9UJY5 639 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa14.68□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 B4E1Z4 1266 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 UFL1O94874 794 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CCDC114Q96M63 670 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TNNQ9UQP3 1299 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SNX14Q9Y5W7 946 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 STX10O60499 249 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 RXRAP19793 462 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SETDB1Q15047 1291 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ABCC2Q92887 1545 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 A0A1B0GVL5 298 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 EBAG9O00559 213 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ATP2C2O75185 946 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CAPN2P17655 700 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TNFAIP3P21580 790 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CA8P35219 290 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ASIC2Q16515 512 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 FAM76AQ8TAV0 307 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 LPIN2Q92539 896 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IFT74Q96LB3 600 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SLC8A3P57103 927 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IGSF22Q8N9C0 903 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ADGRL2O95490 1459 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CDAN1Q8IWY9 1227 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IFT81Q8WYA0 676 aa14.67□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 KRT24Q2M2I5 525 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CROCCP2Q86T23 111 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SUPT20HQ8NEM7 779 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ERO1AQ96HE7 468 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ARMT1Q9H993 441 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PICK1Q9NRD5 415 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ATP7AQ04656 1500 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PAK1Q13153 545 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TTC38Q5R3I4 469 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 DPH6Q7L8W6 267 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 A6NNZ2 444 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 KRT5P13647 590 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 STRN3Q13033 797 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TUBB8Q3ZCM7 444 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 UBL4BQ8N7F7 174 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 VPS18Q9P253 973 aa14.66□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ADCY7P51828 1080 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 NLRP12P59046 1061 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CPLX4Q7Z7G2 160 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CFAP57Q96MR6 1250 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CHL1O00533 1208 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 KBTBD3Q8NAB2 608 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 KIAA0232Q92628 1395 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 SGSM2O43147 1006 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 GPAA1O43292 621 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 PLIN2Q99541 437 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 GPCPD1Q9NPB8 672 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 CETN3O15182 167 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 TRIM7Q9C029 511 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 OGFRQ9NZT2 677 aa14.65□□□□□ -0.06
TNS1-205ENST00000419504 RHOXF2BP0C7M4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 TRERF1Q96PN7 1200 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 NKIRAS1Q9NYS0 192 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 ATP10AO60312 1499 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 PZPP20742 1482 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 BIRC3Q13489 604 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 INF2Q27J81 1249 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 SWAP70Q9UH65 585 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 TSKSQ9UJT2 592 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 CFAP157Q5JU67 520 aa14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TNS1-205ENST00000419504 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.3 ms