RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376362.1

GKAP1-201, Transcript of G kinase anchoring protein 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene GKAP1, Length 1,237 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKAP1-201ENST00000376362 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.32□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ACAD11Q709F0 780 aa7.32□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.32□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 RHOVQ96L33 236 aa7.32□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 MEGF11A6BM72 1044 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 PF4P02776 101 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 CYP11A1P05108 521 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 MAOBP27338 520 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 PPP2R3AQ06190 1150 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 POU4F3Q15319 338 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 VPS37DQ86XT2 251 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 KIAA0825Q8IV33 1275 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 DHX38Q92620 1227 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GPRASP2Q96D09 838 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 USP26Q9BXU7 913 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 AKTIPQ9H8T0 292 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 CACNA2D2Q9NY47 1150 aa7.31□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ATF4P18848 351 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ATP2B1P20020 1258 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GARTP22102 1010 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 NME2P22392 152 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 PCNX4Q63HM2 1172 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 AGMOQ6ZNB7 445 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 SULF2Q8IWU5 870 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa7.3□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 ARNTP27540 789 aa7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 LMNB2Q03252 620 aa7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 RASGRP4Q8TDF6 673 aa7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.29□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GREM1O60565 184 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 MED26O95402 600 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 MCF2L2Q86YR7 1114 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 RNF208Q9H0X6 261 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 SUGCTQ9HAC7 445 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa7.28□□□□□ -1.24
GKAP1-201ENST00000376362 KIAA1324LA8MWY0 1029 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 GSC2O15499 205 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 ZNF862O60290 1169 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 TIAF1O95411 115 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 FGRP09769 529 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 WDR89Q96FK6 387 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 CORO1BQ9BR76 489 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 KRT82Q9NSB4 513 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 UBP1Q9NZI7 540 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa7.27□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 TRIM42Q8IWZ5 723 aa7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SMG8Q8ND04 991 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 WDR18Q9BV38 432 aa7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SAMM50Q9Y512 469 aa7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa7.26□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 TGFB1P01137 390 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 LMNB1P20700 586 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 GRIK1P39086 918 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 CRKP46108 304 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SEC16BQ96JE7 1060 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 EMILIN2Q9BXX0 1053 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 CBX8Q9HC52 389 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 GINM1Q9NU53 330 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 CYP8B1Q9UNU6 501 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 EFR3BQ9Y2G0 817 aa7.25□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 AOC2O75106 756 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 F13A1P00488 732 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 IGLV1-40P01703 118 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 GLB1P16278 677 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 LIG1P18858 919 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 PREPP48147 710 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 NASPP49321 788 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 SEPT6Q14141 434 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.24□□□□□ -1.25
GKAP1-201ENST00000376362 FBXO27Q8NI29 283 aa7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms