RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355233.9

PTPRD-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRD, Length 8,251 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-201ENST00000355233 LMNB1P20700 586 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 GNA11P29992 359 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SYKP43405 635 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 TMEM87BQ96K49 555 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 JRKLQ9Y4A0 524 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SEMA3EO15041 775 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 BAG3O95817 575 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 ALS2CLQ60I27 953 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CNNM4Q6P4Q7 775 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 USP19O94966 1318 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CASQ2O14958 399 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CCDC82Q8N4S0 544 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 UTP11Q9Y3A2 253 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 SLC12A7Q9Y666 1083 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 SCP2P22307 547 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 NBPF4Q96M43 638 aa5.5□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 LMAN1P49257 510 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 MYL5Q02045 173 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 GOLGA8HP0CJ92 632 aa5.49□□□□□ -1.53
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PTPRD-201ENST00000355233 SPATS2LQ9NUQ6 558 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 LRP2BPQ9P2M1 347 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 HLA-DOAP06340 250 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 RLBP1P12271 317 aa5.49□□□□□ -1.53
PTPRD-201ENST00000355233 CFAP221Q4G0U5 840 aa5.49□□□□□ -1.53
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