RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 TIGD1Q96MW7 591 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 RASGRF1Q13972 1273 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 BRAPQ7Z569 592 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 IFNL3Q8IZI9 196 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 MST1RQ04912 1400 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 SLC5A1P13866 664 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC34Q96HJ3 373 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 CARD10Q9BWT7 1032 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 SLU7O95391 586 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 LONRF3Q496Y0 759 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 DPF2Q92785 391 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 FANCLQ9NW38 375 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS2-201ENST00000329078 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SEC31AO94979 1220 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CYP7A1P22680 504 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CASP1P29466 404 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 GRIN1Q05586 938 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CABP5Q9NP86 173 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 URI1O94763 535 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 WTAPQ15007 396 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 LCORLQ8N3X6 602 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 KCNH3Q9ULD8 1083 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 C5P01031 1676 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 YEATS4O95619 227 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 GYS2P54840 703 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF3Q9H094 633 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 JCADQ9P266 1359 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 TMEM232C9JQI7 657 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ATP6V1AP38606 617 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 RTN1Q16799 776 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 AGXT2Q9BYV1 514 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 NACAP1Q9BZK3 213 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SALL1Q9NSC2 1324 aa22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 TOP1P11387 765 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 PDE8AO60658 829 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 GYG1P46976 350 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP12P59046 1061 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SHC4Q6S5L8 630 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SLIT3O75094 1523 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CCZ1BP86790 482 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SLC39A14Q15043 492 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 TAF3Q5VWG9 929 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 MNS1Q8NEH6 495 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ZMYM6O95789 1325 aa22.8■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 DHX58Q96C10 678 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ARMCX5Q6P1M9 558 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 VPS54Q9P1Q0 977 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 CMA1P23946 247 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SUSD4Q5VX71 490 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ATL3Q6DD88 541 aa22.79■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 RASSF8Q8NHQ8 419 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ADKP55263 362 aaKnown RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 OXER1Q8TDS5 423 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF446Q9NWS9 450 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PQ27 194 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PQ64 194 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 A0A1W2PQD8 194 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 GSDMDP57764 484 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 USP49Q70CQ1 688 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 NBPF11Q86T75 865 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 LPIN2Q92539 896 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.78■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 FAM205CA6NFA0 338 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 RFX7Q2KHR2 1363 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 UBXN4Q92575 508 aa22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
SPNS2-201ENST00000329078 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 ERO1AQ96HE7 468 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CSF1RP07333 972 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 NEMFO60524 1076 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 CLCN6P51797 869 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 MYL5Q02045 173 aa22.76■■□□□ 1.23
SPNS2-201ENST00000329078 AKNAD1Q5T1N1 836 aa22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.6 ms