RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000325897.4

CLVS1-201, Transcript of clavesin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CLVS1, Length 3,486 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-201ENST00000325897 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 SMTNL1A8MU46 457 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 TATP17735 454 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ACTN2P35609 894 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ADCY1Q08828 1119 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 USP4Q13107 963 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 CDCA2Q69YH5 1023 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 AK7Q96M32 723 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 KIF9Q9HAQ2 790 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 SENP2Q9HC62 589 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 COMMD8Q9NX08 183 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 RGL1Q9NZL6 768 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 EIF3FO00303 357 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ATP6V1G1O75348 118 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GNAI2P04899 355 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GPTP24298 496 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 CA8P35219 290 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 RANBP1P43487 201 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 PDE4BQ07343 736 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 DDR1Q08345 913 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 KIAA1328Q86T90 577 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 PDILTQ8N807 584 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD44Q8N8A2 993 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 SLC43A3Q8NBI5 491 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GABPB2Q8TAK5 448 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ERMNQ8TAM6 284 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 ZBTB10Q96DT7 871 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 GPATCH3Q96I76 525 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 MPP4Q96JB8 637 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 PAGR1Q9BTK6 254 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 MRFAP1Q9Y605 127 aa5.65□□□□□ -1.5
CLVS1-201ENST00000325897 SLIT3O75094 1523 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 RNMTO43148 476 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 NPM3O75607 178 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 GNAI3P08754 354 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PARP10Q53GL7 1025 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 CEP85Q6P2H3 762 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 BARGINQ6ZT62 677 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SPC24Q8NBT2 197 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SMARCE1Q969G3 411 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 INCENPQ9NQS7 918 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PRDM11Q9NQV5 511 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 RGS12O14924 1447 aa5.65□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 TNS3Q68CZ2 1445 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PPFIA3O75145 1194 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 IL4RP24394 825 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 RPL13P26373 211 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 MICALCLQ6ZW33 695 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SLF2Q8IX21 1173 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PEX5LQ8IYB4 626 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 RETREG2Q8NC44 543 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 ANKK1Q8NFD2 765 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 FAM76AQ8TAV0 307 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SLC35B4Q969S0 331 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SAAL1Q96ER3 474 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 MTRQ99707 1265 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SLC39A3Q9BRY0 314 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 FAM107BQ9H098 131 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 UBAP1Q9NZ09 502 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SPG7Q9UQ90 795 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 WDR37Q9Y2I8 494 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PDLIM1O00151 329 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 KCNQ3O43525 872 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 DDIT3P35638 169 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SCRN1Q12765 414 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 BMP2KLQ5H9B9 411 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 BRINP3Q76B58 766 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 PLPP6Q8IY26 295 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SNX21Q969T3 373 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SCYL1Q96KG9 808 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 MUC3BQ9H195 1237 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 DCTPP1Q9H773 170 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SLAIN2Q9P270 581 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 MTA2O94776 668 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 HOXB7P09629 217 aa5.64□□□□□ -1.51
CLVS1-201ENST00000325897 SMYD1Q8NB12 490 aa5.64□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms