RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000322060.9

PUS1-201, Transcript of pseudouridylate synthase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene PUS1, Length 1,206 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS1-201ENST00000322060 RARSP54136 660 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 PICK1Q9NRD5 415 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.06■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 A0A0G2JLL6 359 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 NPM3O75607 178 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MVPQ14764 893 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 ABCF2Q9UG63 623 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa23.05■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 A0A1B0GUL7 405 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 GRK4P32298 578 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 NKX2-3Q8TAU0 364 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 RAET1EQ8TD07 263 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 XAGE2Q96GT9 111 aa23.04■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 SRGAP3O43295 1099 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 TBC1D12O60347 775 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MYCP01106 439 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 FCGRTP55899 365 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MYH2Q9UKX2 1941 aa23.03■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 TFCP2Q12800 502 aa23.02■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MTFR1Q15390 333 aa23.02■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa23.02■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 MYPNQ86TC9 1320 aa23.02■■□□□ 1.28
PUS1-201ENST00000322060 CYP2C8P10632 490 aa23.01■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 BTDP43251 543 aa23.01■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 RHBDL3P58872 404 aa23.01■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 MECOMQ03112 1051 aa23.01■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 ERICH6Q7L0X2 663 aa23.01■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 GJB1P08034 283 aa23■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 GJA8P48165 433 aa23■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 LDHCP07864 332 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 SLAIN1Q8ND83 568 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 ZNF384Q8TF68 577 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 SHISA4Q96DD7 197 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 HMG20BQ9P0W2 317 aa22.99■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 DOCK2Q92608 1830 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 CCL5P13501 91 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 CAPN2P17655 700 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 UBXN2AP68543 259 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 GSTO1P78417 241 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 PRKCZQ05513 592 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 CCER2I3L3R5 266 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 PICALMQ13492 652 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 GADL1Q6ZQY3 521 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 SPATA5Q8NB90 893 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 NEUROD6Q96NK8 337 aa22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 H0YGN5 161 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 TBC1D2Q9BYX2 928 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 RNF208Q9H0X6 261 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 GABRQQ9UN88 632 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa22.96■■□□□ 1.27
PUS1-201ENST00000322060 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 GNAI2P04899 355 aa22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 SLURP2P0DP57 97 aa22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 IRF5Q13568 498 aa22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PXYLP1Q8TE99 480 aa22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP22.95■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 TRIM75PA6NK02 468 aa22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 TRIM27P14373 513 aa22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 GORABQ5T7V8 394 aa22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PROCA1Q8NCQ7 364 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP22.94■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.93■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 FLT3LGP49771 235 aa22.93■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP22.93■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PNMA3Q9UL41 463 aa22.93■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 DOCK1Q14185 1865 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PHIPQ8WWQ0 1821 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 ADCY3O60266 1144 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 HTATIP2Q9BUP3 242 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 MGAMO43451 1857 aa22.92■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PTPRFP10586 1907 aa22.91■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa22.91■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 IGSF3O75054 1194 aa22.91■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 SGPL1O95470 568 aa22.91■■□□□ 1.26
PUS1-201ENST00000322060 PI16Q6UXB8 463 aa22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms