RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319331.3

LRRN1-201, Transcript of leucine rich repeat neuronal 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN1, Length 3,823 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN1-201ENST00000319331 ATRIPQ8WXE1 791 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PPM1EQ8WY54 764 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 BLZF1Q9H2G9 400 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PARP3Q9Y6F1 533 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GPAA1O43292 621 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 TFRCP02786 760 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PLEKHG3A1L390 1219 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SASH3O75995 380 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CTDNEP1O95476 244 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 HAUS7Q99871 368 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CDC23Q9UJX2 597 aa16.99■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SLC39A14Q15043 492 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SPA17Q15506 151 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CD163L1Q9NR16 1453 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RBL2Q08999 1139 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC96Q2M329 555 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ENGASEQ8NFI3 743 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 IL15P40933 162 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 STIM1Q13586 685 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CASP8Q14790 479 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 POLR3EQ9NVU0 708 aa16.98■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 KIF28PB7ZC32 967 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 IKBKBO14920 756 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ZAP70P43403 619 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF174Q15697 407 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ZNF790Q6PG37 636 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CEP57Q86XR8 500 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 MAST3O60307 1309 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 LRP2BPQ9P2M1 347 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 MYO3AQ8NEV4 1616 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PTPRMP28827 1452 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RNF40O75150 1001 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 RTN1Q16799 776 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CNGA4Q8IV77 575 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GSPT2Q8IYD1 628 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 MLKLQ8NB16 471 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM47Q96LD4 638 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 DSCC1Q9BVC3 393 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 NACAP1Q9BZK3 213 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 POLD4Q9HCU8 107 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SAMM50Q9Y512 469 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 KDRP35968 1356 aa16.97■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 LMTK2Q8IWU2 1503 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CUTAO60888 179 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 IGKV5-2P06315 115 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CHRNA2Q15822 529 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 OSBP2Q969R2 916 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 AKAP2Q9Y2D5 859 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 M0R2C6 588 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 HOXB7P09629 217 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SRLQ86TD4 932 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 OTUD6BQ8N6M0 293 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 GOLGA6L10A6NI86 522 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 NDUFAB1O14561 156 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 TEX33O43247 280 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 ERLIN2O94905 339 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 MAATS1Q7Z4T9 603 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 IFT81Q8WYA0 676 aa16.96■□□□□ 0.31
LRRN1-201ENST00000319331 CPS1P31327 1500 aa16.96■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 TRIM75PA6NK02 468 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 ATP1A2P50993 1020 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 MFSD6Q6ZSS7 791 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 KCNH5Q8NCM2 988 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 BCAS4Q8TDM0 211 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 NRXN1Q9ULB1 1477 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 H3BQF6 201 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 WTAPQ15007 396 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 ROBO2Q9HCK4 1378 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 ATP8B1O43520 1251 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 IDEP14735 1019 aa16.95■□□□□ 0.3
LRRN1-201ENST00000319331 CTDSPL2Q05D32 466 aa16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms