RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 KIF5CO60282 957 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ME1P48163 572 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SLC4A10Q6U841 1118 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PDILTQ8N807 584 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CRACR2AQ9BSW2 395 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PDE6BP35913 854 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PRPHP41219 470 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ADKP55263 362 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 MTF1Q14872 753 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 KIAA1328Q86T90 577 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 INTS13Q9NVM9 706 aa19.81■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 A0A0U1RQJ8 604 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC175P0C221 793 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF569Q5MCW4 686 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM74Q86UV6 250 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 TRIM73Q86UV7 250 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC50Q8IVM0 306 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 C3orf20Q8ND61 904 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 OR8K1Q8NGG5 319 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ATRIPQ8WXE1 791 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 GDAP1L1Q96MZ0 367 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 HOMER3Q9NSC5 361 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 A0A1B0GVL5 298 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CTAGE9A4FU28 777 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ATP8B2P98198 1209 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ANKRD1Q15327 319 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CYB5D1Q6P9G0 228 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PAGR1Q9BTK6 254 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 XRN1Q8IZH2 1706 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 FAM83GA6ND36 823 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 AMPHP49418 695 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 MICALCLQ6ZW33 695 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SCLT1Q96NL6 688 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 BATF3Q9NR55 127 aa19.8■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 F6X3S4 739 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 FYB1O15117 783 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 NDUFA8P51970 172 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CREB3L3Q68CJ9 461 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CDK19Q9BWU1 502 aa19.79■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 A0A1W2PP64 1363 aa19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC148Q8NFR7 591 aa19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 RSRC1Q96IZ7 334 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 CCT4P50991 539 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 MTA1Q13330 715 aa19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 FUKQ8N0W3 1084 aa19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 MYO6Q9UM54 1294 aa19.78■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 GOLGA6BA6NDN3 693 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PSMA5P28066 241 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SLC8A1P32418 973 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 USP14P54578 494 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 DCTN1Q14203 1278 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGEF25Q86VW2 580 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 PCDHA7Q9UN72 937 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 ADGRG1Q9Y653 693 aa19.77■□□□□ 0.76
GLIS1-201ENST00000312233 SKOR1P84550 965 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 HSPA2P54652 639 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 MYL5Q02045 173 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 PDCLQ13371 301 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 MYSM1Q5VVJ2 828 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SLC35F6Q8N357 371 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 RUFY2Q8WXA3 655 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 HOOK2Q96ED9 719 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SLC39A2Q9NP94 309 aa19.76■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SLC4A2P04920 1241 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 FAM163BP0C2L3 166 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 MCM3P25205 808 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SOWAHDA6NJG2 315 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 PYGLP06737 847 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 KCNA6P17658 529 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 ACCSLQ4AC99 568 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 SELENOOQ9BVL4 669 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 RPS6KB1P23443 525 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 NAA35Q5VZE5 725 aa19.75■□□□□ 0.75
GLIS1-201ENST00000312233 NCAPH2Q6IBW4 605 aa19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms