RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296031.4

CXCL2-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CXCL2, Length 577 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL2-201ENST00000296031 MIGA2Q7L4E1 593 aa30.34■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP30.34■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.34■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 PLCG2P16885 1265 aa30.33■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
CXCL2-201ENST00000296031 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa30.32■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K9P80192 1104 aa30.32■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.32■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP30.32■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 CSRNP1Q96S65 589 aa30.32■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 TSHZ3Q63HK5 1081 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 WRNIP1Q96S55 665 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF341Q9BYN7 854 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 ELP3Q9H9T3 547 aa30.31■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 SPRYD7Q5W111 196 aa30.3■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP30.3■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 MIGA1Q8NAN2 632 aa30.3■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 CSADQ9Y600 493 aa30.3■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 FOCADQ5VW36 1801 aa30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 PDE6AP16499 860 aa30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 VGLL4Q14135 290 aa30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 WNK4Q96J92 1243 aa30.29■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 CERS3Q8IU89 383 aa30.28■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 MYH7P12883 1935 aa30.28■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 IGHDP01880 384 aa30.27■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP30.27■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa30.27■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.26■■■□□ 2.44
CXCL2-201ENST00000296031 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SMC5Q8IY18 1101 aa30.26■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP30.26■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.26■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ATRNL1Q5VV63 1379 aa30.26■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF532Q9HCE3 1301 aa30.25■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa30.25■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 OPTNQ96CV9 577 aa30.25■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ZNF112Q9UJU3 913 aa30.25■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa30.24■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 CA12O43570 354 aa30.24■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 INPP5BP32019 993 aa30.24■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 GJA5P36382 358 aa30.24■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 TSKSQ9UJT2 592 aa30.24■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 FLT1P17948 1338 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ERC2O15083 957 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MX1P20591 662 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MAP3K10Q02779 954 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 CNKSR2Q8WXI2 1034 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa30.23■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SLURP2P0DP57 97 aa30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ADD2P35612 726 aa30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SREBF2Q12772 1141 aa30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 LAMB1P07942 1786 aa30.22■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 USP5P45974 858 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 TM4SF4P48230 202 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 LBX1P52954 281 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 OTUD5Q96G74 571 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 DHX36Q9H2U1 1008 aaKnown RBP30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SALL3Q9BXA9 1300 aa30.21■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP30.2■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.2■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.2■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 RNF186Q9NXI6 227 aa30.2■■■□□ 2.43
CXCL2-201ENST00000296031 MYH1P12882 1939 aa30.2■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 SPDYE5A6NIY4 337 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 PHF20L1A8MW92 1017 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 TBC1D12O60347 775 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 TRPA1O75762 1119 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 UBE3CQ15386 1083 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 LNPKQ9C0E8 428 aa30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP30.19■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 SIPA1L1O43166 1804 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 FAM196BA6NMK8 535 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 INHBEP58166 350 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 ERO1BQ86YB8 467 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 KBTBD3Q8NAB2 608 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 SAGE1Q9NXZ1 904 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 PI4KBQ9UBF8 816 aa30.18■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 CHGBP05060 677 aa30.17■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 STAP2Q9UGK3 403 aa30.17■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 PALD1Q9ULE6 856 aa30.17■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 NUCB1Q02818 461 aa30.16■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 CHD1LQ86WJ1 897 aa30.16■■■□□ 2.42
CXCL2-201ENST00000296031 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
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