RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283228.6

PTPRR-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 3,529 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-201ENST00000283228 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
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PTPRR-201ENST00000283228 IL17REQ8NFR9 667 aa12.93□□□□□ -0.34
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PTPRR-201ENST00000283228 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
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PTPRR-201ENST00000283228 PHKBQ93100 1093 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SELENOOQ9BVL4 669 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 SERTAD1Q9UHV2 236 aa12.89□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 PRR36Q9H6K5 1346 aa12.88□□□□□ -0.35
PTPRR-201ENST00000283228 GRM8O00222 908 aa12.88□□□□□ -0.35
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PTPRR-201ENST00000283228 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP12.88□□□□□ -0.35
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