RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261917.3

HCN4-201, Transcript of hyperpolarization activated cyclic nucleotide gated potassium channel 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HCN4, Length 7,228 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4-201ENST00000261917 KCNA6P17658 529 aa20.27■□□□□ 0.84
HCN4-201ENST00000261917 SF3A3Q12874 501 aaKnown RBP eCLIP20.27■□□□□ 0.84
HCN4-201ENST00000261917 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 TBC1D32Q96NH3 1257 aa20.27■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 V9GY48 417 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 SPOPO43791 374 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 SEL1L2Q5TEA6 688 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 PHACTR3Q96KR7 559 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 ORAI2Q96SN7 254 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 G2E3Q7L622 706 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 AZI2Q9H6S1 392 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 RDH13Q8NBN7 331 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 KIFAP3Q92845 792 aa20.26■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 HGSO14964 777 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 RSPH14Q9UHP6 348 aa20.25■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP20.25■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 MED10Q9BTT4 135 aa20.24■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 IL16Q14005 1332 aa20.24■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 ASXL2Q76L83 1435 aa20.24■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 SLC1A4P43007 532 aa20.24■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 PHKBQ93100 1093 aa20.24■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 LGR6Q9HBX8 967 aa20.24■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 TRIM7Q9C029 511 aa20.24■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 PDE8AO60658 829 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 SESTD1Q86VW0 696 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 GTF2IP78347 998 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 BEND3Q5T5X7 828 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 NELFCDQ8IXH7 590 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 FLT4P35916 1363 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 H7C1D1 291 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 HSPA4P34932 840 aa20.23■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 ZNF790Q6PG37 636 aa20.23■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 INF2Q27J81 1249 aa20.22■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 RPL13P26373 211 aaKnown RBP20.22■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa20.22■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 CASC4Q6P4E1 433 aa20.22■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 MYO1AQ9UBC5 1043 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 TRIM31Q9BZY9 425 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 SPAG1Q07617 926 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 TPH2Q8IWU9 490 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.21■□□□□ 0.83
HCN4-201ENST00000261917 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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HCN4-201ENST00000261917 BSPRYQ5W0U4 402 aa20.2■□□□□ 0.82
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HCN4-201ENST00000261917 JAKMIP2Q96AA8 810 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 VPS18Q9P253 973 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 TNNI3KQ59H18 835 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 SYT10Q6XYQ8 523 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 EPSTI1Q96J88 318 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 USP40Q9NVE5 1235 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 HSPA1LP34931 641 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 IGBP1P78318 339 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 ARFGAP3Q9NP61 516 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 CDAN1Q8IWY9 1227 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 FAM227BQ96M60 508 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 GPAA1O43292 621 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 IP6K1Q92551 441 aa20.2■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.19■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.19■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 GLG1Q92896 1179 aa20.19■□□□□ 0.82
HCN4-201ENST00000261917 PKNOX2Q96KN3 472 aa20.19■□□□□ 0.82
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