RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261889.9

SNX1-201, Transcript of sorting nexin 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNX1, Length 3,373 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1-201ENST00000261889 NR5A1Q13285 461 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX1-201ENST00000261889 KRT40Q6A162 431 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX1-201ENST00000261889 KRBA2Q6ZNG9 492 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX1-201ENST00000261889 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
SNX1-201ENST00000261889 RHOXF2Q9BQY4 288 aa14.96□□□□□ -0.01
SNX1-201ENST00000261889 GPAA1O43292 621 aa14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 XAGE2Q96GT9 111 aa14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TIGD1Q96MW7 591 aa14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SALL1Q9NSC2 1324 aa14.96□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 VWA3AA6NCI4 1184 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 BTBD18B2RXH4 712 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CDC25AP30304 524 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PARP3Q9Y6F1 533 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ATRNO75882 1429 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TEX33O43247 280 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NEMFO60524 1076 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NUP133Q8WUM0 1156 aa14.95□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ZNF213O14771 459 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 REXO1L1PQ8IX06 675 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 C10orf67Q8IYJ2 551 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 FBXO41Q8TF61 875 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CARD10Q9BWT7 1032 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.94□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PHKG2P15735 406 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TPM4P67936 248 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 FOXR1Q6PIV2 292 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC150Q8NCX0 1101 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 KCNG4Q8TDN1 519 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MYL5Q02045 173 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC93Q567U6 631 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PARD6BQ9BYG5 372 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 L2HGDHQ9H9P8 463 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SERTAD1Q9UHV2 236 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 UTYO14607 1347 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 H3BQF6 201 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CASQ1P31415 396 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ITGB4P16144 1822 aa14.93□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TADA3O75528 432 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PPP2R3AQ06190 1150 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 OXER1Q8TDS5 423 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NBPF3Q9H094 633 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PES1O00541 588 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ZMYND10O75800 440 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TBC1D8O95759 1140 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SYCP1Q15431 976 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 LRP10Q7Z4F1 713 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PRDM11Q9NQV5 511 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 BCLAF1Q9NYF8 920 aaKnown RBP eCLIP14.92□□□□□ -0.025e-7■■□□□ 12.3
SNX1-201ENST00000261889 KCNH3Q9ULD8 1083 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MTMR7Q9Y216 660 aa14.92□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 EYA2O00167 538 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PRKAB2O43741 272 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NRDCO43847 1150 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PRDM1O75626 825 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC57Q2TAC2 916 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 OLFM4Q6UX06 510 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SH3TC1Q8TE82 1336 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CCDC66A2RUB6 948 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CAVIN2O95810 425 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MIGA1Q8NAN2 632 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 POLD4Q9HCU8 107 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 WWC3Q9ULE0 1092 aa14.91□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ERCC3P19447 782 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ACRBPQ8NEB7 543 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 NCOA7Q8NI08 942 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 VPS18Q9P253 973 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 ZNF831Q5JPB2 1677 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SBF2Q86WG5 1849 aa14.9□□□□□ -0.02
SNX1-201ENST00000261889 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.8 ms