RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP25.53■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 PDE1AP54750 535 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 PRKG1Q13976 671 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 SLFNL1Q499Z3 407 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 ZFPM1Q8IX07 1006 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 FAM151AQ8WW52 585 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 CSRNP1Q96S65 589 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 SAGE1Q9NXZ1 904 aa25.52■■□□□ 1.68
COX5B-201ENST00000258424 ERC2O15083 957 aa25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 CHGBP05060 677 aa25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 PPP4CP60510 307 aa25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP25.51■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 UBE2Q2LH0YL09 131 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 ADD2P35612 726 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 PICALMQ13492 652 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 SUPT20HL1Q3ZLR7 823 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 RASAL3Q86YV0 1011 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 RNF186Q9NXI6 227 aa25.5■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 ENTPD3O75355 529 aa25.49■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 TRPA1O75762 1119 aa25.49■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 BAG3O95817 575 aa25.49■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 TEX11Q8IYF3 940 aa25.49■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 CCDC85CA6NKD9 419 aa25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 KBTBD3Q8NAB2 608 aa25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 MCOLN1Q9GZU1 580 aa25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP25.48■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 PDE4AP27815 886 aa25.47■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP25.47■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 SIPA1L1O43166 1804 aa25.47■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 MYH1P12882 1939 aa25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 NEFLP07196 543 aa25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 PLCG2P16885 1265 aa25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 DGKZQ13574 1117 aa25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K11Q16584 847 aa25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP25.46■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 ATRNL1Q5VV63 1379 aa25.45■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 NAV1Q8NEY1 1877 aa25.45■■□□□ 1.67
COX5B-201ENST00000258424 DDTLA6NHG4 134 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 USP2O75604 605 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 NPM3O75607 178 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 ARMC9Q7Z3E5 817 aa25.45■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP25.45■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 UBE3CQ15386 1083 aa25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 LDLRAD1Q5T700 205 aa25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 FLT1P17948 1338 aa25.43■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa25.43■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 OSBPL3Q9H4L5 887 aa25.43■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.42■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 CERS3Q8IU89 383 aa25.42■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.42■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 LCORLQ8N3X6 602 aa25.42■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 SLURP2P0DP57 97 aa25.41■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 MIGA2Q7L4E1 593 aa25.41■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 FSD1Q9BTV5 496 aa25.41■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 ARMT1Q9H993 441 aa25.41■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 MBD4O95243 580 aa25.4■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 IREB2P48200 963 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 CLMNQ96JQ2 1002 aa25.4■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.4■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 DCAF15Q66K64 600 aa25.39■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 DDX55Q8NHQ9 600 aaKnown RBP eCLIP25.39■■□□□ 1.662e-20■■■□□ 15.9
COX5B-201ENST00000258424 HOOK2Q96ED9 719 aa25.39■■□□□ 1.66
COX5B-201ENST00000258424 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP25.39■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 USP5P45974 858 aa25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 TM4SF4P48230 202 aa25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 OSBP2Q969R2 916 aa25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 EVI5LQ96CN4 794 aa25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 APPBP2Q92624 585 aa25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ZNF341Q9BYN7 854 aa25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP25.37■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 LAMB1P07942 1786 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 FAM196BA6NMK8 535 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 PRKAB2O43741 272 aa25.36■■□□□ 1.65
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa25.36■■□□□ 1.65
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