RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 SERPINA10Q9UK55 444 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa31.04■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 PCNTO95613 3336 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 CLRN2A0PK11 232 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa31.03■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MECOMQ03112 1051 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 MTMR14Q8NCE2 650 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 RAD50Q92878 1312 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ADM5C9JUS6 153 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 USP48Q86UV5 1035 aa31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP31.02■■■□□ 2.56
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5JP18859 108 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CCDC183Q5T5S1 534 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TEKT1Q969V4 418 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 LRP2BPQ9P2M1 347 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 MYH2Q9UKX2 1941 aa31.01■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 FSTL1Q12841 308 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RAI14Q9P0K7 980 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PTMAP06454 111 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ECHDC1Q9NTX5 307 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa31■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 KRT26Q7Z3Y9 468 aa30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP30.99■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 GOLIM4O00461 696 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNB3P54284 484 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRHLA0A096LP55 91 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SGSM2O43147 1006 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UQCRHP07919 91 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 MMP14P50281 582 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZDHHC15Q96MV8 337 aa30.98■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 HHIPL2Q6UWX4 724 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PASKQ96RG2 1323 aa30.97■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CHGBP05060 677 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 HTRA3P83110 453 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 MRIQ9BWK5 157 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 IDH1O75874 414 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UBE2HP62256 183 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ADGRA1Q86SQ6 560 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF214Q8ND24 703 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PI4K2BQ8TCG2 481 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CHAMP1Q96JM3 812 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 VEZTQ9HBM0 779 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 MAST3O60307 1309 aa30.96■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 SLFNL1Q499Z3 407 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC37L1Q7L3B6 337 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC14Q96N46 770 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 HAUS7Q99871 368 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa30.95■■■□□ 2.55
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ECM29Q5VYK3 1845 aa30.94■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SPDYE2Q495Y8 402 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PAG1Q9NWQ8 432 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC41PQ6P2S7 1318 aa30.93■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SULF1Q8IWU6 871 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GAKO14976 1311 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 SNX14Q9Y5W7 946 aa30.92■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CDAN1Q8IWY9 1227 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 RUFY2Q8WXA3 655 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 DOCK2Q92608 1830 aa30.91■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 TCP10L2B9ZVM9 353 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 CST9Q5W186 159 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PRIMPOLQ96LW4 560 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF408Q9H9D4 720 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 STX6O43752 255 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MYO1BO43795 1136 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 MAGEB6Q8N7X4 407 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMYND15Q9H091 742 aa30.9■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP30.9■■■□□ 2.548e-17■□□□□ 10.3
CAPNS1-201ENST00000246533 BTDP43251 543 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 GPATCH3Q96I76 525 aa30.89■■■□□ 2.54
CAPNS1-201ENST00000246533 NFIAQ12857 509 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 PIBF1Q8WXW3 757 aa30.88■■■□□ 2.53
CAPNS1-201ENST00000246533 DEFB129Q9H1M3 183 aa30.88■■■□□ 2.53
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