RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000240159.8

RNF170-201, Transcript of ring finger protein 170, humanhuman

TSL 2

Gene RNF170, Length 2,023 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF170-201ENST00000240159 PTPDC1A2A3K4 754 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SBK1Q52WX2 424 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SENP2Q9HC62 589 aa26.63■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SGMS1Q86VZ5 419 aa26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 LMBRD1Q9NUN5 540 aa26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 LAMB1P07942 1786 aa26.62■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FGRP09769 529 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 LIFRP42702 1097 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 MTA3Q9BTC8 594 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 G3V3G9 751 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 PCP11498 1178 aaKnown RBP26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 BTDP43251 543 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 DCAF8Q5TAQ9 597 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 CERS3Q8IU89 383 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SLF2Q8IX21 1173 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 ESR2Q92731 530 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FBXW7Q969H0 707 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa26.61■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 USP5P45974 858 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 CDC37L1Q7L3B6 337 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 FAM184AQ8NB25 1140 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 GAKO14976 1311 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SNED1Q8TER0 1413 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 EVX2Q03828 476 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 APOA5Q6Q788 366 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 CERS5Q8N5B7 392 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 MCM9Q9NXL9 1143 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa26.6■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 CYP2D6P10635 497 aa26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 GSE1Q14687 1217 aa26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 SART3Q15020 963 aaKnown RBP26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 NFXL1Q6ZNB6 911 aa26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa26.59■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa26.58■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 PODNQ7Z5L7 613 aa26.58■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 DBNDD1Q9H9R9 158 aa26.58■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 USP17L8P0C7I0 530 aa26.58■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP26.58■■□□□ 1.85
RNF170-201ENST00000240159 TGFBRAP1Q8WUH2 860 aa26.57■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 KIF3AQ9Y496 699 aa26.57■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 PRDM1O75626 825 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 WTAPQ15007 396 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 MXD3Q9BW11 206 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ERICH2A1L162 156 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 CCDC69A6NI79 296 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ZBTB43O43298 467 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ORC4O43929 436 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 PLCG2P16885 1265 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 UBAC1Q9BSL1 405 aa26.56■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 PPFIA3O75145 1194 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 FDPSP14324 419 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 RHBDL3P58872 404 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 C12orf60Q5U649 245 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 TTLL6Q8N841 843 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 SLC12A7Q9Y666 1083 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 CPLX1O14810 134 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 C21orf2O43822 256 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 RXRAP19793 462 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 MICU3Q86XE3 530 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 TMTC2Q8N394 836 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 NAV1Q8NEY1 1877 aa26.55■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 F8W031 263 aaPredicted RBP26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 FERMT3Q86UX7 667 aa26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 TEX11Q8IYF3 940 aa26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 KCNQ5Q9NR82 932 aa26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP26.54■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 H3BQV1 296 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ZBTB7AO95365 584 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 DPEP1P16444 411 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 KCNA3P22001 575 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 SEC23AQ15436 765 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 KLHL40Q2TBA0 621 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 IFFO2Q5TF58 517 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 MYL10Q9BUA6 226 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 TNKSO95271 1327 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ECE2O60344 883 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ADD1P35611 737 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
RNF170-201ENST00000240159 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.7 ms