RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000220325.8

EHD4-201, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene EHD4, Length 6,416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-201ENST00000220325 CCDC117Q8IWD4 279 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 LRRC45Q96CN5 670 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 USTQ9Y2C2 406 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TRPC3Q13507 836 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 WDR44Q5JSH3 913 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 PSMB7Q99436 277 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SH2D4AQ9H788 454 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SLAIN2Q9P270 581 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 USP19O94966 1318 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 HMGXB3Q12766 1538 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 CTAGE9A4FU28 777 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ARHGEF35A5YM69 484 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 RASAL2Q9UJF2 1139 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ZNF532Q9HCE3 1301 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 POLR2DO15514 142 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GYG1P46976 350 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SLC52A2Q9HAB3 445 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 BEND3Q5T5X7 828 aa15.94■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 BICDL2A1A5D9 508 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SLC27A2O14975 620 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ZEB2O60315 1214 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 LRMPQ12912 555 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 METTL13Q8N6R0 699 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 USP40Q9NVE5 1235 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SYT10Q6XYQ8 523 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 LUC7L2Q9Y383 392 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 KIF4AO95239 1232 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TRIM31Q9BZY9 425 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GEN1Q17RS7 908 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 DAPK3O43293 454 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TFAP4Q01664 338 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 PARP10Q53GL7 1025 aa15.93■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 KRT86O43790 486 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SPOPO43791 374 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ABL1P00519 1130 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 EPB41P11171 864 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 MFSD14BQ5SR56 506 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SPATA5Q8NB90 893 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 PPM1EQ8WY54 764 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 STX10O60499 249 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 STRN3Q13033 797 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 RALGAPBQ86X10 1494 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SMTNP53814 917 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 IFT74Q96LB3 600 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ATP10BO94823 1461 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 BLZF1Q9H2G9 400 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 VPS54Q9P1Q0 977 aa15.92■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 POTEB2H3BUK9 544 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 CD19P15391 556 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 MYCT1Q8N699 235 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SNX29Q8TEQ0 813 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GLG1Q92896 1179 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 IGSF3O75054 1194 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 RSPH14Q9UHP6 348 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GOLGA8HP0CJ92 632 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 MICALCLQ6ZW33 695 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SDR42E1Q8WUS8 393 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 AZI2Q9H6S1 392 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ZBED4O75132 1171 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 PTPROQ16827 1216 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 ATP2A1O14983 1001 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 RPS6KB1P23443 525 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 CCDC122Q5T0U0 273 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 CFAP58Q5T655 872 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GADL1Q6ZQY3 521 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TPH2Q8IWU9 490 aa15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 BAG6P46379 1132 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 HELLSQ9NRZ9 838 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 H7C1D1 291 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 GABPAQ06546 454 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 C8orf34Q49A92 452 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 E7EVH7 732 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 USP26Q9BXU7 913 aa15.9■□□□□ 0.14
EHD4-201ENST00000220325 TNFAIP3P21580 790 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms