RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000054666.10

VAMP3-201, Transcript of vesicle associated membrane protein 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VAMP3, Length 2,205 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3-201ENST00000054666 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SMIM5Q71RC9 77 aa9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SDR42E1Q8WUS8 393 aa9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 ESR2Q92731 530 aa9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 GJD4Q96KN9 370 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQ27 194 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQ64 194 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1W2PQD8 194 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SPTLC2O15270 562 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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VAMP3-201ENST00000054666 ADALQ6DHV7 355 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 FBXO33Q7Z6M2 555 aa9.59□□□□□ -0.87
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VAMP3-201ENST00000054666 LINC00301Q8NCQ3 95 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
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VAMP3-201ENST00000054666 SLC26A6Q9BXS9 759 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 KIAA2012Q0VF49 1180 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 TRAPPC3LQ5T215 181 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 FAM182BQ5T319 152 aa9.59□□□□□ -0.87
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VAMP3-201ENST00000054666 KRT40Q6A162 431 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 STK11IPQ8N1F8 1099 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 JMYQ8N9B5 988 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SENP2Q9HC62 589 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 INCENPQ9NQS7 918 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 ANAPC4Q9UJX5 808 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 TAOK2Q9UL54 1235 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 PCDHA7Q9UN72 937 aa9.59□□□□□ -0.87
VAMP3-201ENST00000054666 SBF2Q86WG5 1849 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 DUOX1Q9NRD9 1551 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 KIF28PB7ZC32 967 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TPM3P06753 285 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 IFNAR1P17181 557 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 ZNF165P49910 485 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 CNBD1Q8NA66 436 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 NKX2-3Q8TAU0 364 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa9.58□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 AFF2P51816 1311 aa9.58□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 NUP133Q8WUM0 1156 aa9.58□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 AIFM3Q96NN9 605 aa9.58□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 GJB4Q9NTQ9 266 aa9.58□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TNKSO95271 1327 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 LAMB1P07942 1786 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 DEXIO95424 95 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 KLRK1P26718 216 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 GRAPQ13588 217 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 PPP2R5BQ15173 497 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 FAM196AQ6ZSG2 479 aa9.57□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 CCDC24Q8N4L8 307 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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VAMP3-201ENST00000054666 SDF4Q9BRK5 362 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 MECOMQ03112 1051 aa9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 CEP57L1Q8IYX8 460 aa9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 ENGASEQ8NFI3 743 aa9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 TACC3Q9Y6A5 838 aa9.56□□□□□ -0.88
VAMP3-201ENST00000054666 A0A1B0GVL5 298 aa9.56□□□□□ -0.88
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