RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000227092.1

CT009556.4-201, mousemouse

BASIC

Gene CT009556.4, Length 200 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Dclk1Q9JLM8 756 aa8.57□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Atrnl1Q6A051 1378 aa8.57□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Pet2A2AHY8 747 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Prl7a2O54831 253 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Cap1P40124 474 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Spata18Q0P557 537 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Spata5Q3UMC0 893 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 HelbQ6NVF4 1074 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Acap3Q6NXL5 833 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Hps4Q99KG7 671 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Rnf181Q9CY62 165 aa8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 PhaxQ9JJT9 385 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Aox4Q3TYQ9 1336 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Zkscan16A2ALW2 728 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Cyp2d34L7N463 504 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Slc4a4O88343 1079 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Vcam1P29533 739 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Wnt10bP48614 389 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Irf6P97431 467 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tmed8Q3UHI4 326 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Map3k12Q60700 888 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Fxr1Q61584 677 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Pramel6Q810Y9 485 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 GorabQ8BRM2 368 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Stn1Q8K2X3 378 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Adam1bQ8R534 806 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Eaf2Q91ZD6 262 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 RragcQ99K70 398 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tbc1d7Q9D0K0 293 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tgm5Q9D7I9 724 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ripk4Q9ERK0 786 aa8.55□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Usp42B2RQC2 1324 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Gm36210A0A1B0GS00 229 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Fbxl16A2RT62 479 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Gm10093D3YYI8 482 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Cntnap3E9PY62 1287 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Usp17ldG5E8G2 545 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Usp17lcG5E8I7 545 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Hdac1O09106 482 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Hap1O35668 628 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 MecomP14404 1042 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ly6dP35459 127 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ercc3P49135 783 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Gnat2P50149 354 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Mmp14P53690 582 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Cacnb3P54285 484 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Traf5P70191 558 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tbc1d2bQ3U0J8 965 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Oog3Q3UWY1 500 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tigd5Q499M4 642 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ctr9Q62018 1173 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tll1Q62381 1013 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Trmt2aQ8BNV1 574 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Jakmip1Q8BVL9 626 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Borcs6Q9D6W8 360 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 EhhadhQ9DBM2 718 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tjap1Q9DCD5 539 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Tfip11Q9ERA6 838 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 RabggtaQ9JHK4 567 aa8.54□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Rgs12Q8CGE9 1381 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Mageb2A2AHM0 380 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Flvcr1B2RXV4 560 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Dhx16G3X8X0 1044 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Casp12O08736 419 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 CnpP16330 420 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Acsl1P41216 699 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Fdx1P46656 188 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Anapc15P60007 132 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Q3TYL0 343 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Lins1Q3U1D0 764 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 MyrflQ3UN70 904 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Lamc2Q61092 1191 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Olfr118Q7TRJ6 321 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Sgsm2Q80U12 1005 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Mrps27Q8BK72 415 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Kbtbd13Q8C828 458 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Rtp1Q8C8C1 263 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ildr1Q8CBR1 537 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Trappc12Q8K2L8 797 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Yipf1Q91VU1 306 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 MsraQ9D6Y7 233 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Plekhg2Q6KAU7 1340 aa8.53□□□□□ -1.04
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Gm42715A0A087WP63 3095 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Ccdc88aQ5SNZ0 1873 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Lbhd1A0A087WPA0 259 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Fam71e1A1L3C1 212 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 1700003F12RikA2AKE5 210 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 CrcpO35427 148 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Pde4aO89084 844 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 DnttP09838 530 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 NapbP28663 298 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Eef2P58252 858 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Q3UK37 420 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Klrg2Q3UM83 387 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Cyp4f37Q3V1F1 546 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Hand2Q61039 217 aa8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 Bms1Q6PGF5 1284 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CT009556.4-201ENSMUST00000227092 LdhdQ7TNG8 484 aa8.52□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 43.3 ms