RNA–Protein interactions for RNA: YFR056C

YFR056C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YFR056C, Length 369 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YFR056CYFR056C YDL129WQ07555 291 aa6□□□□□ -1.45
YFR056CYFR056C SAM3Q08986 587 aa5.99□□□□□ -1.45
YFR056CYFR056C DPS1P04802 557 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C GYP5Q12344 894 aa5.96□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C ABP1P15891 592 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C MAK11P20484 414 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C RAM2P29703 316 aa5.95□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C MIF2P35201 549 aa5.95□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C SRC1Q03707 834 aa5.93□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C HTA1P04911 132 aaKnown RBP5.91□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C HTA2P04912 132 aa5.91□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C DCW1P36091 449 aa5.91□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C JIP4Q03361 876 aa5.91□□□□□ -1.46
YFR056CYFR056C GRE2Q12068 342 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C ATH1P48016 1211 aa5.87□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C COQ8P27697 501 aa5.86□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C PTC3P34221 468 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C YEL023CP39992 682 aa5.85□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C EDS1P38073 919 aa5.84□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C PTC4P38089 393 aa5.84□□□□□ -1.47
YFR056CYFR056C GUT1P32190 709 aa5.83□□□□□ -1.48
YFR056CYFR056C NOP53Q12080 455 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
YFR056CYFR056C ELP4Q02884 456 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
YFR056CYFR056C PML39Q03760 334 aa5.74□□□□□ -1.49
YFR056CYFR056C SET1P38827 1080 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
YFR056CYFR056C SOL3P38858 249 aa5.69□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C AI4P03878 556 aa5.68□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C MPH3P0CE00 602 aa5.68□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C YGR273CP53329 174 aa5.68□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C PEX29Q03370 554 aa5.67□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C ARH1P48360 493 aa5.66□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C NST1P53935 1240 aa5.66□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C MID1P41821 548 aa5.65□□□□□ -1.5
YFR056CYFR056C IFH1P39520 1085 aa5.63□□□□□ -1.51
YFR056CYFR056C RAS1P01119 309 aa5.62□□□□□ -1.51
YFR056CYFR056C ILV3P39522 585 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
YFR056CYFR056C KEX1P09620 729 aa5.58□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C SPT23P35210 1082 aa5.58□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C SLI15P38283 698 aa5.57□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C VHR2P40041 505 aa5.57□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C HAP5Q02516 242 aa5.57□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C MPC54Q08550 464 aa5.56□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C UBP14P38237 781 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C DPL1Q05567 589 aa5.54□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C YLR326WQ06170 240 aaKnown RBP5.54□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C RPP1BP10622 106 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C RAD54P32863 898 aa5.53□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C KIC1P38692 1080 aa5.53□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C NMA111P53920 997 aa5.53□□□□□ -1.52
YFR056CYFR056C PTC2P39966 464 aaKnown RBP5.51□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C VPS70P47161 811 aa5.51□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C BNI4P53858 892 aa5.51□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C YPR148CQ06523 435 aa5.51□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C PCS60P38137 543 aaKnown RBP RIP-Chip data5.5□□□□□ -1.53not detected
YFR056CYFR056C REF2P42073 533 aaPredicted RBP5.5□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C YPL062WQ02781 134 aa5.5□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C DMA1P38823 416 aa5.49□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C ISU2Q12056 156 aa5.49□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C YML082WQ04533 649 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C CDC73Q06697 393 aa5.48□□□□□ -1.53
YFR056CYFR056C YDR090CQ03193 310 aa5.45□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C TRK1P12685 1235 aa5.44□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C PEX21P50091 288 aa5.44□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C MAK21Q12176 1025 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C CKB1P43639 278 aa5.42□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C COX6P00427 148 aa5.4□□□□□ -1.54
YFR056CYFR056C CSC1Q06538 782 aa5.39□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C YPR015CQ12531 247 aa5.39□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C PDR1P12383 1068 aa5.37□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C GYP1Q08484 637 aa5.37□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C TFB4Q12004 338 aa5.37□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C YRR1Q12172 810 aa5.37□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C PBS2P08018 668 aa5.36□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C TUM1Q08686 304 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C RAM1P22007 431 aa5.35□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C AMS1P22855 1083 aa5.34□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C ORC6P38826 435 aa5.34□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP5.34□□□□□ -1.55
YFR056CYFR056C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C GAP1P19145 602 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C NPL4P33755 580 aa5.32□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C SAS4Q04003 481 aa5.32□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C SDH2P21801 266 aa5.31□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C SPB4P25808 606 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C MVP1P40959 511 aaKnown RBP5.31□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C MAM3Q12296 706 aa5.31□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C NUD1P32336 851 aa5.3□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C YPR109WQ06104 294 aa5.29□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C PRT1P06103 763 aaKnown RBP5.28□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C RGR1P19263 1082 aa5.28□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C MRF1P30775 413 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
YFR056CYFR056C BUD20Q08004 166 aaPredicted RBP5.27□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C GAR1P28007 205 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C PSE1P32337 1089 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C GCD11P32481 527 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C DSF2P38213 736 aa5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C STR2P47164 639 aa5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C ISM1P48526 1002 aa5.26□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C IES2P40154 320 aa5.25□□□□□ -1.57
YFR056CYFR056C YEL077CQ3E7X8 1277 aa5.25□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 8.7 ms